Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ctdnep1Q3TP92 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ctdnep1Q3TP92 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ctdnep1Q3TP92 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ctdnep1Q3TP92 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ctdnep1Q3TP92 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ctdnep1Q3TP92 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ctdnep1Q3TP92 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ctdnep1Q3TP92 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ctdnep1Q3TP92 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ctdnep1Q3TP92 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ctdnep1Q3TP92 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ctdnep1Q3TP92 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ctdnep1Q3TP92 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ctdnep1Q3TP92 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ctdnep1Q3TP92 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ctdnep1Q3TP92 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ctdnep1Q3TP92 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ctdnep1Q3TP92 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ctdnep1Q3TP92 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ctdnep1Q3TP92 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ctdnep1Q3TP92 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ctdnep1Q3TP92 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ctdnep1Q3TP92 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ctdnep1Q3TP92 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ctdnep1Q3TP92 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ctdnep1Q3TP92 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ctdnep1Q3TP92 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ctdnep1Q3TP92 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ctdnep1Q3TP92 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ctdnep1Q3TP92 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ctdnep1Q3TP92 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ctdnep1Q3TP92 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ctdnep1Q3TP92 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ctdnep1Q3TP92 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ctdnep1Q3TP92 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ctdnep1Q3TP92 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ctdnep1Q3TP92 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ctdnep1Q3TP92 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ctdnep1Q3TP92 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ctdnep1Q3TP92 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ctdnep1Q3TP92 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Ctdnep1Q3TP92 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Ctdnep1Q3TP92 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ctdnep1Q3TP92 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ctdnep1Q3TP92 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ctdnep1Q3TP92 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ctdnep1Q3TP92 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ctdnep1Q3TP92 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ctdnep1Q3TP92 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ctdnep1Q3TP92 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Ctdnep1Q3TP92 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ctdnep1Q3TP92 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ctdnep1Q3TP92 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ctdnep1Q3TP92 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ctdnep1Q3TP92 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ctdnep1Q3TP92 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ctdnep1Q3TP92 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ctdnep1Q3TP92 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ctdnep1Q3TP92 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ctdnep1Q3TP92 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ctdnep1Q3TP92 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ctdnep1Q3TP92 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ctdnep1Q3TP92 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Ctdnep1Q3TP92 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ctdnep1Q3TP92 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ctdnep1Q3TP92 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ctdnep1Q3TP92 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ctdnep1Q3TP92 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ctdnep1Q3TP92 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ctdnep1Q3TP92 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ctdnep1Q3TP92 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ctdnep1Q3TP92 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ctdnep1Q3TP92 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ctdnep1Q3TP92 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ctdnep1Q3TP92 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ctdnep1Q3TP92 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ctdnep1Q3TP92 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ctdnep1Q3TP92 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ctdnep1Q3TP92 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ctdnep1Q3TP92 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ctdnep1Q3TP92 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ctdnep1Q3TP92 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ctdnep1Q3TP92 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ctdnep1Q3TP92 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ctdnep1Q3TP92 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ctdnep1Q3TP92 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ctdnep1Q3TP92 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ctdnep1Q3TP92 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ctdnep1Q3TP92 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ctdnep1Q3TP92 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ctdnep1Q3TP92 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ctdnep1Q3TP92 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ctdnep1Q3TP92 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ctdnep1Q3TP92 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ctdnep1Q3TP92 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ctdnep1Q3TP92 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ctdnep1Q3TP92 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ctdnep1Q3TP92 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ctdnep1Q3TP92 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms