Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMP1

Gtf3c3, General transcription factor IIIC, polypeptide 3, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c3Q3TMP1 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gtf3c3Q3TMP1 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gtf3c3Q3TMP1 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gtf3c3Q3TMP1 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gtf3c3Q3TMP1 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gtf3c3Q3TMP1 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gtf3c3Q3TMP1 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gtf3c3Q3TMP1 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gtf3c3Q3TMP1 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gtf3c3Q3TMP1 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gtf3c3Q3TMP1 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gtf3c3Q3TMP1 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Gtf3c3Q3TMP1 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gtf3c3Q3TMP1 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gtf3c3Q3TMP1 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gtf3c3Q3TMP1 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gtf3c3Q3TMP1 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gtf3c3Q3TMP1 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Gtf3c3Q3TMP1 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gtf3c3Q3TMP1 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Gtf3c3Q3TMP1 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gtf3c3Q3TMP1 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gtf3c3Q3TMP1 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gtf3c3Q3TMP1 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gtf3c3Q3TMP1 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gtf3c3Q3TMP1 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gtf3c3Q3TMP1 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gtf3c3Q3TMP1 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gtf3c3Q3TMP1 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gtf3c3Q3TMP1 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gtf3c3Q3TMP1 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gtf3c3Q3TMP1 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gtf3c3Q3TMP1 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gtf3c3Q3TMP1 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gtf3c3Q3TMP1 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gtf3c3Q3TMP1 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gtf3c3Q3TMP1 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gtf3c3Q3TMP1 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gtf3c3Q3TMP1 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gtf3c3Q3TMP1 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gtf3c3Q3TMP1 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Gtf3c3Q3TMP1 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gtf3c3Q3TMP1 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gtf3c3Q3TMP1 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gtf3c3Q3TMP1 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gtf3c3Q3TMP1 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gtf3c3Q3TMP1 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gtf3c3Q3TMP1 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gtf3c3Q3TMP1 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gtf3c3Q3TMP1 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gtf3c3Q3TMP1 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gtf3c3Q3TMP1 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gtf3c3Q3TMP1 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gtf3c3Q3TMP1 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gtf3c3Q3TMP1 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gtf3c3Q3TMP1 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gtf3c3Q3TMP1 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gtf3c3Q3TMP1 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gtf3c3Q3TMP1 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gtf3c3Q3TMP1 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gtf3c3Q3TMP1 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gtf3c3Q3TMP1 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gtf3c3Q3TMP1 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gtf3c3Q3TMP1 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gtf3c3Q3TMP1 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gtf3c3Q3TMP1 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gtf3c3Q3TMP1 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gtf3c3Q3TMP1 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gtf3c3Q3TMP1 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gtf3c3Q3TMP1 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gtf3c3Q3TMP1 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gtf3c3Q3TMP1 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gtf3c3Q3TMP1 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gtf3c3Q3TMP1 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gtf3c3Q3TMP1 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gtf3c3Q3TMP1 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gtf3c3Q3TMP1 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gtf3c3Q3TMP1 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gtf3c3Q3TMP1 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gtf3c3Q3TMP1 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gtf3c3Q3TMP1 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gtf3c3Q3TMP1 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gtf3c3Q3TMP1 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gtf3c3Q3TMP1 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gtf3c3Q3TMP1 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gtf3c3Q3TMP1 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gtf3c3Q3TMP1 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gtf3c3Q3TMP1 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gtf3c3Q3TMP1 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gtf3c3Q3TMP1 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gtf3c3Q3TMP1 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gtf3c3Q3TMP1 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gtf3c3Q3TMP1 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gtf3c3Q3TMP1 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gtf3c3Q3TMP1 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gtf3c3Q3TMP1 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gtf3c3Q3TMP1 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gtf3c3Q3TMP1 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gtf3c3Q3TMP1 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gtf3c3Q3TMP1 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms