Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX9

Usp39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp39Q3TIX9 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp39Q3TIX9 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp39Q3TIX9 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp39Q3TIX9 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp39Q3TIX9 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp39Q3TIX9 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp39Q3TIX9 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp39Q3TIX9 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp39Q3TIX9 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp39Q3TIX9 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp39Q3TIX9 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp39Q3TIX9 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp39Q3TIX9 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp39Q3TIX9 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp39Q3TIX9 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp39Q3TIX9 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp39Q3TIX9 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp39Q3TIX9 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp39Q3TIX9 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp39Q3TIX9 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp39Q3TIX9 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp39Q3TIX9 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp39Q3TIX9 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp39Q3TIX9 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp39Q3TIX9 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp39Q3TIX9 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp39Q3TIX9 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp39Q3TIX9 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp39Q3TIX9 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp39Q3TIX9 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp39Q3TIX9 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp39Q3TIX9 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp39Q3TIX9 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp39Q3TIX9 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp39Q3TIX9 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp39Q3TIX9 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp39Q3TIX9 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp39Q3TIX9 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp39Q3TIX9 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp39Q3TIX9 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp39Q3TIX9 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp39Q3TIX9 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp39Q3TIX9 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp39Q3TIX9 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp39Q3TIX9 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp39Q3TIX9 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp39Q3TIX9 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp39Q3TIX9 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp39Q3TIX9 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp39Q3TIX9 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp39Q3TIX9 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp39Q3TIX9 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp39Q3TIX9 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp39Q3TIX9 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp39Q3TIX9 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp39Q3TIX9 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp39Q3TIX9 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp39Q3TIX9 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp39Q3TIX9 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp39Q3TIX9 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp39Q3TIX9 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp39Q3TIX9 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp39Q3TIX9 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp39Q3TIX9 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp39Q3TIX9 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp39Q3TIX9 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp39Q3TIX9 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp39Q3TIX9 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp39Q3TIX9 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp39Q3TIX9 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp39Q3TIX9 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp39Q3TIX9 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp39Q3TIX9 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp39Q3TIX9 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp39Q3TIX9 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp39Q3TIX9 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp39Q3TIX9 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp39Q3TIX9 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp39Q3TIX9 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp39Q3TIX9 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp39Q3TIX9 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp39Q3TIX9 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp39Q3TIX9 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp39Q3TIX9 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp39Q3TIX9 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp39Q3TIX9 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp39Q3TIX9 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp39Q3TIX9 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp39Q3TIX9 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp39Q3TIX9 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp39Q3TIX9 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp39Q3TIX9 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp39Q3TIX9 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp39Q3TIX9 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp39Q3TIX9 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp39Q3TIX9 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp39Q3TIX9 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp39Q3TIX9 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp39Q3TIX9 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp39Q3TIX9 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms