Protein–RNA interactions for Protein: Q3TCJ8

Ccdc69, Coiled-coil domain-containing protein 69, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc69Q3TCJ8 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc69Q3TCJ8 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc69Q3TCJ8 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc69Q3TCJ8 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc69Q3TCJ8 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc69Q3TCJ8 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc69Q3TCJ8 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc69Q3TCJ8 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc69Q3TCJ8 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc69Q3TCJ8 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc69Q3TCJ8 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc69Q3TCJ8 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc69Q3TCJ8 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc69Q3TCJ8 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc69Q3TCJ8 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc69Q3TCJ8 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc69Q3TCJ8 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc69Q3TCJ8 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc69Q3TCJ8 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc69Q3TCJ8 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc69Q3TCJ8 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc69Q3TCJ8 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc69Q3TCJ8 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc69Q3TCJ8 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc69Q3TCJ8 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc69Q3TCJ8 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc69Q3TCJ8 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc69Q3TCJ8 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc69Q3TCJ8 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc69Q3TCJ8 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc69Q3TCJ8 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc69Q3TCJ8 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc69Q3TCJ8 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc69Q3TCJ8 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc69Q3TCJ8 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc69Q3TCJ8 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc69Q3TCJ8 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc69Q3TCJ8 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc69Q3TCJ8 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc69Q3TCJ8 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc69Q3TCJ8 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc69Q3TCJ8 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc69Q3TCJ8 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc69Q3TCJ8 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc69Q3TCJ8 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc69Q3TCJ8 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc69Q3TCJ8 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc69Q3TCJ8 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ccdc69Q3TCJ8 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ccdc69Q3TCJ8 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc69Q3TCJ8 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc69Q3TCJ8 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc69Q3TCJ8 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc69Q3TCJ8 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc69Q3TCJ8 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc69Q3TCJ8 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc69Q3TCJ8 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc69Q3TCJ8 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc69Q3TCJ8 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc69Q3TCJ8 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc69Q3TCJ8 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc69Q3TCJ8 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc69Q3TCJ8 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc69Q3TCJ8 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc69Q3TCJ8 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc69Q3TCJ8 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc69Q3TCJ8 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc69Q3TCJ8 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc69Q3TCJ8 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc69Q3TCJ8 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc69Q3TCJ8 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc69Q3TCJ8 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc69Q3TCJ8 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc69Q3TCJ8 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc69Q3TCJ8 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc69Q3TCJ8 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc69Q3TCJ8 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc69Q3TCJ8 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc69Q3TCJ8 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc69Q3TCJ8 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc69Q3TCJ8 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc69Q3TCJ8 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc69Q3TCJ8 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc69Q3TCJ8 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc69Q3TCJ8 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc69Q3TCJ8 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc69Q3TCJ8 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc69Q3TCJ8 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc69Q3TCJ8 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc69Q3TCJ8 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc69Q3TCJ8 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc69Q3TCJ8 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc69Q3TCJ8 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc69Q3TCJ8 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc69Q3TCJ8 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc69Q3TCJ8 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc69Q3TCJ8 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc69Q3TCJ8 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc69Q3TCJ8 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc69Q3TCJ8 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms