Protein–RNA interactions for Protein: Q3TB48

Tmem104, Transmembrane protein 104, mousemouse

Predictions only

Length 496 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem104Q3TB48 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem104Q3TB48 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem104Q3TB48 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem104Q3TB48 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem104Q3TB48 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem104Q3TB48 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem104Q3TB48 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem104Q3TB48 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem104Q3TB48 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem104Q3TB48 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem104Q3TB48 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem104Q3TB48 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem104Q3TB48 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem104Q3TB48 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem104Q3TB48 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem104Q3TB48 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem104Q3TB48 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem104Q3TB48 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem104Q3TB48 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem104Q3TB48 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem104Q3TB48 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem104Q3TB48 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem104Q3TB48 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem104Q3TB48 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem104Q3TB48 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem104Q3TB48 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem104Q3TB48 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem104Q3TB48 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem104Q3TB48 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem104Q3TB48 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem104Q3TB48 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem104Q3TB48 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem104Q3TB48 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem104Q3TB48 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem104Q3TB48 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem104Q3TB48 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem104Q3TB48 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem104Q3TB48 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem104Q3TB48 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem104Q3TB48 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem104Q3TB48 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem104Q3TB48 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem104Q3TB48 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem104Q3TB48 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem104Q3TB48 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem104Q3TB48 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem104Q3TB48 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem104Q3TB48 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem104Q3TB48 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem104Q3TB48 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem104Q3TB48 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem104Q3TB48 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem104Q3TB48 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem104Q3TB48 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem104Q3TB48 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem104Q3TB48 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem104Q3TB48 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem104Q3TB48 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem104Q3TB48 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem104Q3TB48 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem104Q3TB48 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem104Q3TB48 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem104Q3TB48 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem104Q3TB48 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem104Q3TB48 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem104Q3TB48 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem104Q3TB48 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem104Q3TB48 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem104Q3TB48 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem104Q3TB48 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem104Q3TB48 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem104Q3TB48 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem104Q3TB48 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem104Q3TB48 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem104Q3TB48 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tmem104Q3TB48 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tmem104Q3TB48 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tmem104Q3TB48 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tmem104Q3TB48 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tmem104Q3TB48 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tmem104Q3TB48 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem104Q3TB48 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem104Q3TB48 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem104Q3TB48 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem104Q3TB48 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem104Q3TB48 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem104Q3TB48 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem104Q3TB48 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem104Q3TB48 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem104Q3TB48 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem104Q3TB48 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem104Q3TB48 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem104Q3TB48 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem104Q3TB48 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem104Q3TB48 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem104Q3TB48 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem104Q3TB48 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem104Q3TB48 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem104Q3TB48 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem104Q3TB48 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88 ms