Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXG2

Fpr-rs6, Formyl peptide receptor-related sequence 6, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fpr-rs6Q3SXG2 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Fpr-rs6Q3SXG2 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Fpr-rs6Q3SXG2 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Fpr-rs6Q3SXG2 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Fpr-rs6Q3SXG2 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Fpr-rs6Q3SXG2 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Fpr-rs6Q3SXG2 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Fpr-rs6Q3SXG2 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Fpr-rs6Q3SXG2 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Fpr-rs6Q3SXG2 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Fpr-rs6Q3SXG2 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Fpr-rs6Q3SXG2 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Fpr-rs6Q3SXG2 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Fpr-rs6Q3SXG2 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Fpr-rs6Q3SXG2 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Fpr-rs6Q3SXG2 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Fpr-rs6Q3SXG2 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Fpr-rs6Q3SXG2 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Fpr-rs6Q3SXG2 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Fpr-rs6Q3SXG2 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Fpr-rs6Q3SXG2 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Fpr-rs6Q3SXG2 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Fpr-rs6Q3SXG2 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Fpr-rs6Q3SXG2 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Fpr-rs6Q3SXG2 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fpr-rs6Q3SXG2 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fpr-rs6Q3SXG2 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fpr-rs6Q3SXG2 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fpr-rs6Q3SXG2 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fpr-rs6Q3SXG2 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fpr-rs6Q3SXG2 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fpr-rs6Q3SXG2 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Fpr-rs6Q3SXG2 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Fpr-rs6Q3SXG2 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fpr-rs6Q3SXG2 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fpr-rs6Q3SXG2 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fpr-rs6Q3SXG2 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fpr-rs6Q3SXG2 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Fpr-rs6Q3SXG2 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fpr-rs6Q3SXG2 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Fpr-rs6Q3SXG2 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Fpr-rs6Q3SXG2 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fpr-rs6Q3SXG2 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fpr-rs6Q3SXG2 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fpr-rs6Q3SXG2 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fpr-rs6Q3SXG2 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fpr-rs6Q3SXG2 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fpr-rs6Q3SXG2 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fpr-rs6Q3SXG2 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fpr-rs6Q3SXG2 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fpr-rs6Q3SXG2 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fpr-rs6Q3SXG2 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fpr-rs6Q3SXG2 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fpr-rs6Q3SXG2 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fpr-rs6Q3SXG2 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fpr-rs6Q3SXG2 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fpr-rs6Q3SXG2 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fpr-rs6Q3SXG2 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fpr-rs6Q3SXG2 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fpr-rs6Q3SXG2 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fpr-rs6Q3SXG2 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fpr-rs6Q3SXG2 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fpr-rs6Q3SXG2 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Fpr-rs6Q3SXG2 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fpr-rs6Q3SXG2 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fpr-rs6Q3SXG2 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fpr-rs6Q3SXG2 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fpr-rs6Q3SXG2 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fpr-rs6Q3SXG2 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fpr-rs6Q3SXG2 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fpr-rs6Q3SXG2 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fpr-rs6Q3SXG2 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fpr-rs6Q3SXG2 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fpr-rs6Q3SXG2 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fpr-rs6Q3SXG2 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fpr-rs6Q3SXG2 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fpr-rs6Q3SXG2 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fpr-rs6Q3SXG2 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fpr-rs6Q3SXG2 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fpr-rs6Q3SXG2 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Fpr-rs6Q3SXG2 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fpr-rs6Q3SXG2 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Fpr-rs6Q3SXG2 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fpr-rs6Q3SXG2 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fpr-rs6Q3SXG2 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fpr-rs6Q3SXG2 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fpr-rs6Q3SXG2 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fpr-rs6Q3SXG2 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fpr-rs6Q3SXG2 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fpr-rs6Q3SXG2 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fpr-rs6Q3SXG2 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fpr-rs6Q3SXG2 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fpr-rs6Q3SXG2 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fpr-rs6Q3SXG2 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fpr-rs6Q3SXG2 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fpr-rs6Q3SXG2 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fpr-rs6Q3SXG2 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fpr-rs6Q3SXG2 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fpr-rs6Q3SXG2 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fpr-rs6Q3SXG2 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms