Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXD3

Hddc2, HD domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc2Q3SXD3 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hddc2Q3SXD3 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hddc2Q3SXD3 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hddc2Q3SXD3 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hddc2Q3SXD3 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hddc2Q3SXD3 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hddc2Q3SXD3 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hddc2Q3SXD3 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hddc2Q3SXD3 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hddc2Q3SXD3 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hddc2Q3SXD3 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hddc2Q3SXD3 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hddc2Q3SXD3 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hddc2Q3SXD3 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hddc2Q3SXD3 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hddc2Q3SXD3 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hddc2Q3SXD3 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hddc2Q3SXD3 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hddc2Q3SXD3 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hddc2Q3SXD3 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hddc2Q3SXD3 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hddc2Q3SXD3 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hddc2Q3SXD3 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hddc2Q3SXD3 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hddc2Q3SXD3 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hddc2Q3SXD3 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hddc2Q3SXD3 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hddc2Q3SXD3 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hddc2Q3SXD3 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hddc2Q3SXD3 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Hddc2Q3SXD3 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hddc2Q3SXD3 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hddc2Q3SXD3 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hddc2Q3SXD3 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hddc2Q3SXD3 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hddc2Q3SXD3 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hddc2Q3SXD3 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hddc2Q3SXD3 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hddc2Q3SXD3 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hddc2Q3SXD3 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hddc2Q3SXD3 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hddc2Q3SXD3 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hddc2Q3SXD3 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hddc2Q3SXD3 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hddc2Q3SXD3 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hddc2Q3SXD3 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hddc2Q3SXD3 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hddc2Q3SXD3 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hddc2Q3SXD3 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hddc2Q3SXD3 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hddc2Q3SXD3 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hddc2Q3SXD3 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hddc2Q3SXD3 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hddc2Q3SXD3 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hddc2Q3SXD3 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hddc2Q3SXD3 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hddc2Q3SXD3 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Hddc2Q3SXD3 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hddc2Q3SXD3 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hddc2Q3SXD3 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Hddc2Q3SXD3 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hddc2Q3SXD3 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hddc2Q3SXD3 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hddc2Q3SXD3 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hddc2Q3SXD3 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hddc2Q3SXD3 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hddc2Q3SXD3 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hddc2Q3SXD3 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hddc2Q3SXD3 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hddc2Q3SXD3 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hddc2Q3SXD3 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hddc2Q3SXD3 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hddc2Q3SXD3 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hddc2Q3SXD3 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hddc2Q3SXD3 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hddc2Q3SXD3 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hddc2Q3SXD3 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hddc2Q3SXD3 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hddc2Q3SXD3 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hddc2Q3SXD3 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hddc2Q3SXD3 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hddc2Q3SXD3 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hddc2Q3SXD3 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hddc2Q3SXD3 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hddc2Q3SXD3 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hddc2Q3SXD3 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hddc2Q3SXD3 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hddc2Q3SXD3 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Hddc2Q3SXD3 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hddc2Q3SXD3 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Hddc2Q3SXD3 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hddc2Q3SXD3 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hddc2Q3SXD3 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hddc2Q3SXD3 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hddc2Q3SXD3 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hddc2Q3SXD3 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hddc2Q3SXD3 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hddc2Q3SXD3 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hddc2Q3SXD3 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hddc2Q3SXD3 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms