Protein–RNA interactions for Protein: Q3MI99

Ccbe1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccbe1Q3MI99 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccbe1Q3MI99 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccbe1Q3MI99 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccbe1Q3MI99 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccbe1Q3MI99 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccbe1Q3MI99 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccbe1Q3MI99 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccbe1Q3MI99 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccbe1Q3MI99 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccbe1Q3MI99 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccbe1Q3MI99 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccbe1Q3MI99 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccbe1Q3MI99 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccbe1Q3MI99 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccbe1Q3MI99 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccbe1Q3MI99 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccbe1Q3MI99 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccbe1Q3MI99 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccbe1Q3MI99 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccbe1Q3MI99 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccbe1Q3MI99 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccbe1Q3MI99 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccbe1Q3MI99 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccbe1Q3MI99 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccbe1Q3MI99 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccbe1Q3MI99 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccbe1Q3MI99 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccbe1Q3MI99 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccbe1Q3MI99 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccbe1Q3MI99 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccbe1Q3MI99 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccbe1Q3MI99 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccbe1Q3MI99 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccbe1Q3MI99 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccbe1Q3MI99 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccbe1Q3MI99 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccbe1Q3MI99 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccbe1Q3MI99 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccbe1Q3MI99 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccbe1Q3MI99 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccbe1Q3MI99 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccbe1Q3MI99 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccbe1Q3MI99 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccbe1Q3MI99 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccbe1Q3MI99 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccbe1Q3MI99 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccbe1Q3MI99 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccbe1Q3MI99 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccbe1Q3MI99 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccbe1Q3MI99 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccbe1Q3MI99 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccbe1Q3MI99 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccbe1Q3MI99 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccbe1Q3MI99 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccbe1Q3MI99 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccbe1Q3MI99 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccbe1Q3MI99 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccbe1Q3MI99 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccbe1Q3MI99 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccbe1Q3MI99 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccbe1Q3MI99 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccbe1Q3MI99 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccbe1Q3MI99 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccbe1Q3MI99 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccbe1Q3MI99 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccbe1Q3MI99 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccbe1Q3MI99 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccbe1Q3MI99 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccbe1Q3MI99 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccbe1Q3MI99 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccbe1Q3MI99 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccbe1Q3MI99 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccbe1Q3MI99 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccbe1Q3MI99 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccbe1Q3MI99 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccbe1Q3MI99 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccbe1Q3MI99 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccbe1Q3MI99 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccbe1Q3MI99 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccbe1Q3MI99 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccbe1Q3MI99 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccbe1Q3MI99 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccbe1Q3MI99 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccbe1Q3MI99 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccbe1Q3MI99 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccbe1Q3MI99 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccbe1Q3MI99 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccbe1Q3MI99 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccbe1Q3MI99 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccbe1Q3MI99 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccbe1Q3MI99 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccbe1Q3MI99 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccbe1Q3MI99 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccbe1Q3MI99 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccbe1Q3MI99 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccbe1Q3MI99 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccbe1Q3MI99 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccbe1Q3MI99 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccbe1Q3MI99 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccbe1Q3MI99 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms