Protein–RNA interactions for Protein: Q3LR78

Zbtb38, CtBP-interacting BTB zinc finger protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb38Q3LR78 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Zbtb38Q3LR78 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Zbtb38Q3LR78 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Zbtb38Q3LR78 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Zbtb38Q3LR78 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Zbtb38Q3LR78 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Zbtb38Q3LR78 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Zbtb38Q3LR78 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Zbtb38Q3LR78 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Zbtb38Q3LR78 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Zbtb38Q3LR78 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Zbtb38Q3LR78 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Zbtb38Q3LR78 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Zbtb38Q3LR78 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Zbtb38Q3LR78 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Zbtb38Q3LR78 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Zbtb38Q3LR78 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Zbtb38Q3LR78 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Zbtb38Q3LR78 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Zbtb38Q3LR78 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Zbtb38Q3LR78 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Zbtb38Q3LR78 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Zbtb38Q3LR78 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Zbtb38Q3LR78 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Zbtb38Q3LR78 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Zbtb38Q3LR78 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Zbtb38Q3LR78 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Zbtb38Q3LR78 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Zbtb38Q3LR78 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Zbtb38Q3LR78 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Zbtb38Q3LR78 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Zbtb38Q3LR78 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Zbtb38Q3LR78 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Zbtb38Q3LR78 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Zbtb38Q3LR78 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Zbtb38Q3LR78 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Zbtb38Q3LR78 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Zbtb38Q3LR78 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Zbtb38Q3LR78 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Zbtb38Q3LR78 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Zbtb38Q3LR78 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Zbtb38Q3LR78 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Zbtb38Q3LR78 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Zbtb38Q3LR78 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Zbtb38Q3LR78 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Zbtb38Q3LR78 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Zbtb38Q3LR78 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Zbtb38Q3LR78 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Zbtb38Q3LR78 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Zbtb38Q3LR78 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Zbtb38Q3LR78 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Zbtb38Q3LR78 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Zbtb38Q3LR78 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Zbtb38Q3LR78 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Zbtb38Q3LR78 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Zbtb38Q3LR78 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Zbtb38Q3LR78 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Zbtb38Q3LR78 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Zbtb38Q3LR78 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Zbtb38Q3LR78 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Zbtb38Q3LR78 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Zbtb38Q3LR78 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Zbtb38Q3LR78 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Zbtb38Q3LR78 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Zbtb38Q3LR78 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Zbtb38Q3LR78 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Zbtb38Q3LR78 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Zbtb38Q3LR78 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Zbtb38Q3LR78 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Zbtb38Q3LR78 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Zbtb38Q3LR78 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Zbtb38Q3LR78 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Zbtb38Q3LR78 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Zbtb38Q3LR78 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Zbtb38Q3LR78 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Zbtb38Q3LR78 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Zbtb38Q3LR78 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Zbtb38Q3LR78 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Zbtb38Q3LR78 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Zbtb38Q3LR78 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Zbtb38Q3LR78 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Zbtb38Q3LR78 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Zbtb38Q3LR78 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Zbtb38Q3LR78 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Zbtb38Q3LR78 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Zbtb38Q3LR78 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Zbtb38Q3LR78 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Zbtb38Q3LR78 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Zbtb38Q3LR78 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Zbtb38Q3LR78 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Zbtb38Q3LR78 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Zbtb38Q3LR78 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Zbtb38Q3LR78 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Zbtb38Q3LR78 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Zbtb38Q3LR78 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Zbtb38Q3LR78 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Zbtb38Q3LR78 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Zbtb38Q3LR78 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Zbtb38Q3LR78 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Zbtb38Q3LR78 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms