Protein–RNA interactions for Protein: Q3KNY5

Riiad1, RIIa domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riiad1Q3KNY5 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Riiad1Q3KNY5 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Riiad1Q3KNY5 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Riiad1Q3KNY5 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Riiad1Q3KNY5 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Riiad1Q3KNY5 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Riiad1Q3KNY5 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Riiad1Q3KNY5 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Riiad1Q3KNY5 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Riiad1Q3KNY5 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Riiad1Q3KNY5 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Riiad1Q3KNY5 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Riiad1Q3KNY5 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Riiad1Q3KNY5 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Riiad1Q3KNY5 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Riiad1Q3KNY5 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Riiad1Q3KNY5 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Riiad1Q3KNY5 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Riiad1Q3KNY5 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Riiad1Q3KNY5 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Riiad1Q3KNY5 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Riiad1Q3KNY5 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Riiad1Q3KNY5 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Riiad1Q3KNY5 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Riiad1Q3KNY5 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Riiad1Q3KNY5 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Riiad1Q3KNY5 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Riiad1Q3KNY5 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Riiad1Q3KNY5 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Riiad1Q3KNY5 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Riiad1Q3KNY5 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Riiad1Q3KNY5 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Riiad1Q3KNY5 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Riiad1Q3KNY5 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Riiad1Q3KNY5 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Riiad1Q3KNY5 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Riiad1Q3KNY5 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Riiad1Q3KNY5 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Riiad1Q3KNY5 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Riiad1Q3KNY5 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Riiad1Q3KNY5 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Riiad1Q3KNY5 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Riiad1Q3KNY5 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Riiad1Q3KNY5 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Riiad1Q3KNY5 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Riiad1Q3KNY5 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Riiad1Q3KNY5 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Riiad1Q3KNY5 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Riiad1Q3KNY5 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Riiad1Q3KNY5 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Riiad1Q3KNY5 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Riiad1Q3KNY5 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Riiad1Q3KNY5 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Riiad1Q3KNY5 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Riiad1Q3KNY5 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Riiad1Q3KNY5 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Riiad1Q3KNY5 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Riiad1Q3KNY5 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Riiad1Q3KNY5 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Riiad1Q3KNY5 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Riiad1Q3KNY5 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Riiad1Q3KNY5 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Riiad1Q3KNY5 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Riiad1Q3KNY5 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Riiad1Q3KNY5 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Riiad1Q3KNY5 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Riiad1Q3KNY5 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Riiad1Q3KNY5 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Riiad1Q3KNY5 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Riiad1Q3KNY5 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Riiad1Q3KNY5 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Riiad1Q3KNY5 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Riiad1Q3KNY5 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Riiad1Q3KNY5 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Riiad1Q3KNY5 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Riiad1Q3KNY5 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Riiad1Q3KNY5 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Riiad1Q3KNY5 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Riiad1Q3KNY5 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Riiad1Q3KNY5 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Riiad1Q3KNY5 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Riiad1Q3KNY5 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Riiad1Q3KNY5 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Riiad1Q3KNY5 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Riiad1Q3KNY5 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Riiad1Q3KNY5 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Riiad1Q3KNY5 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Riiad1Q3KNY5 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Riiad1Q3KNY5 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Riiad1Q3KNY5 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Riiad1Q3KNY5 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Riiad1Q3KNY5 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Riiad1Q3KNY5 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Riiad1Q3KNY5 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Riiad1Q3KNY5 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Riiad1Q3KNY5 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Riiad1Q3KNY5 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Riiad1Q3KNY5 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Riiad1Q3KNY5 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Riiad1Q3KNY5 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms