Protein–RNA interactions for Protein: Q3KNL4

UPF0728 protein C10orf53 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3KNL4 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q3KNL4 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q3KNL4 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q3KNL4 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q3KNL4 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q3KNL4 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q3KNL4 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q3KNL4 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q3KNL4 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q3KNL4 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q3KNL4 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q3KNL4 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q3KNL4 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q3KNL4 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q3KNL4 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q3KNL4 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q3KNL4 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q3KNL4 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q3KNL4 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q3KNL4 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q3KNL4 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q3KNL4 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q3KNL4 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q3KNL4 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q3KNL4 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q3KNL4 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q3KNL4 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q3KNL4 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q3KNL4 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q3KNL4 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q3KNL4 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q3KNL4 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q3KNL4 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q3KNL4 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q3KNL4 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q3KNL4 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q3KNL4 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q3KNL4 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q3KNL4 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q3KNL4 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q3KNL4 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q3KNL4 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q3KNL4 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q3KNL4 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q3KNL4 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q3KNL4 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q3KNL4 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q3KNL4 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q3KNL4 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q3KNL4 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q3KNL4 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q3KNL4 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q3KNL4 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q3KNL4 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q3KNL4 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q3KNL4 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q3KNL4 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q3KNL4 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Q3KNL4 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q3KNL4 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q3KNL4 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q3KNL4 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q3KNL4 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q3KNL4 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q3KNL4 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q3KNL4 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q3KNL4 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q3KNL4 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q3KNL4 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q3KNL4 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q3KNL4 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q3KNL4 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q3KNL4 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q3KNL4 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q3KNL4 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q3KNL4 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q3KNL4 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q3KNL4 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Q3KNL4 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q3KNL4 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q3KNL4 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q3KNL4 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q3KNL4 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q3KNL4 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q3KNL4 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q3KNL4 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q3KNL4 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q3KNL4 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q3KNL4 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q3KNL4 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q3KNL4 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q3KNL4 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q3KNL4 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q3KNL4 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Q3KNL4 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q3KNL4 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q3KNL4 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q3KNL4 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q3KNL4 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q3KNL4 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms