Protein–RNA interactions for Protein: Q2TJ95

Rspo3, R-spondin-3, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rspo3Q2TJ95 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rspo3Q2TJ95 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rspo3Q2TJ95 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rspo3Q2TJ95 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rspo3Q2TJ95 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rspo3Q2TJ95 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rspo3Q2TJ95 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rspo3Q2TJ95 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rspo3Q2TJ95 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rspo3Q2TJ95 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rspo3Q2TJ95 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rspo3Q2TJ95 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rspo3Q2TJ95 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rspo3Q2TJ95 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rspo3Q2TJ95 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rspo3Q2TJ95 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rspo3Q2TJ95 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rspo3Q2TJ95 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rspo3Q2TJ95 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rspo3Q2TJ95 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rspo3Q2TJ95 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rspo3Q2TJ95 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rspo3Q2TJ95 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rspo3Q2TJ95 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rspo3Q2TJ95 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rspo3Q2TJ95 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rspo3Q2TJ95 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rspo3Q2TJ95 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rspo3Q2TJ95 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Rspo3Q2TJ95 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rspo3Q2TJ95 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rspo3Q2TJ95 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rspo3Q2TJ95 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rspo3Q2TJ95 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rspo3Q2TJ95 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rspo3Q2TJ95 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Rspo3Q2TJ95 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rspo3Q2TJ95 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rspo3Q2TJ95 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rspo3Q2TJ95 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rspo3Q2TJ95 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rspo3Q2TJ95 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rspo3Q2TJ95 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Rspo3Q2TJ95 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Rspo3Q2TJ95 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Rspo3Q2TJ95 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Rspo3Q2TJ95 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rspo3Q2TJ95 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rspo3Q2TJ95 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rspo3Q2TJ95 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rspo3Q2TJ95 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rspo3Q2TJ95 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rspo3Q2TJ95 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rspo3Q2TJ95 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rspo3Q2TJ95 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rspo3Q2TJ95 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rspo3Q2TJ95 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rspo3Q2TJ95 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rspo3Q2TJ95 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rspo3Q2TJ95 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rspo3Q2TJ95 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rspo3Q2TJ95 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rspo3Q2TJ95 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rspo3Q2TJ95 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rspo3Q2TJ95 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rspo3Q2TJ95 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rspo3Q2TJ95 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rspo3Q2TJ95 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rspo3Q2TJ95 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rspo3Q2TJ95 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rspo3Q2TJ95 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rspo3Q2TJ95 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rspo3Q2TJ95 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rspo3Q2TJ95 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rspo3Q2TJ95 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rspo3Q2TJ95 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rspo3Q2TJ95 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rspo3Q2TJ95 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rspo3Q2TJ95 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rspo3Q2TJ95 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rspo3Q2TJ95 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rspo3Q2TJ95 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rspo3Q2TJ95 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rspo3Q2TJ95 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rspo3Q2TJ95 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rspo3Q2TJ95 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rspo3Q2TJ95 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rspo3Q2TJ95 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rspo3Q2TJ95 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rspo3Q2TJ95 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rspo3Q2TJ95 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rspo3Q2TJ95 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rspo3Q2TJ95 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rspo3Q2TJ95 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rspo3Q2TJ95 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rspo3Q2TJ95 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rspo3Q2TJ95 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rspo3Q2TJ95 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rspo3Q2TJ95 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rspo3Q2TJ95 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms