Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKI2

Vax1, Ventral anterior homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vax1Q2NKI2 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vax1Q2NKI2 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Vax1Q2NKI2 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vax1Q2NKI2 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vax1Q2NKI2 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vax1Q2NKI2 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vax1Q2NKI2 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vax1Q2NKI2 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vax1Q2NKI2 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vax1Q2NKI2 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vax1Q2NKI2 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vax1Q2NKI2 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vax1Q2NKI2 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vax1Q2NKI2 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vax1Q2NKI2 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vax1Q2NKI2 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vax1Q2NKI2 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vax1Q2NKI2 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vax1Q2NKI2 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Vax1Q2NKI2 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vax1Q2NKI2 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vax1Q2NKI2 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Vax1Q2NKI2 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Vax1Q2NKI2 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vax1Q2NKI2 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vax1Q2NKI2 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vax1Q2NKI2 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vax1Q2NKI2 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Vax1Q2NKI2 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vax1Q2NKI2 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Vax1Q2NKI2 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vax1Q2NKI2 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vax1Q2NKI2 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vax1Q2NKI2 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vax1Q2NKI2 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Vax1Q2NKI2 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vax1Q2NKI2 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vax1Q2NKI2 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vax1Q2NKI2 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vax1Q2NKI2 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vax1Q2NKI2 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vax1Q2NKI2 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vax1Q2NKI2 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Vax1Q2NKI2 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vax1Q2NKI2 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vax1Q2NKI2 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vax1Q2NKI2 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vax1Q2NKI2 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vax1Q2NKI2 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vax1Q2NKI2 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vax1Q2NKI2 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vax1Q2NKI2 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vax1Q2NKI2 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vax1Q2NKI2 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vax1Q2NKI2 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vax1Q2NKI2 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vax1Q2NKI2 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vax1Q2NKI2 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vax1Q2NKI2 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vax1Q2NKI2 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vax1Q2NKI2 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vax1Q2NKI2 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Vax1Q2NKI2 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vax1Q2NKI2 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vax1Q2NKI2 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Vax1Q2NKI2 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vax1Q2NKI2 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vax1Q2NKI2 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vax1Q2NKI2 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vax1Q2NKI2 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vax1Q2NKI2 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vax1Q2NKI2 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vax1Q2NKI2 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vax1Q2NKI2 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vax1Q2NKI2 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vax1Q2NKI2 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vax1Q2NKI2 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vax1Q2NKI2 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vax1Q2NKI2 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vax1Q2NKI2 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vax1Q2NKI2 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vax1Q2NKI2 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vax1Q2NKI2 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vax1Q2NKI2 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vax1Q2NKI2 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vax1Q2NKI2 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vax1Q2NKI2 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vax1Q2NKI2 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vax1Q2NKI2 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Vax1Q2NKI2 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Vax1Q2NKI2 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vax1Q2NKI2 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vax1Q2NKI2 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vax1Q2NKI2 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vax1Q2NKI2 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vax1Q2NKI2 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vax1Q2NKI2 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vax1Q2NKI2 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vax1Q2NKI2 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vax1Q2NKI2 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms