Protein–RNA interactions for Protein: Q2LKU9

Nlrp1a, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1a, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp1aQ2LKU9 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Nlrp1aQ2LKU9 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Nlrp1aQ2LKU9 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Nlrp1aQ2LKU9 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Nlrp1aQ2LKU9 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nlrp1aQ2LKU9 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nlrp1aQ2LKU9 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nlrp1aQ2LKU9 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nlrp1aQ2LKU9 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nlrp1aQ2LKU9 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nlrp1aQ2LKU9 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nlrp1aQ2LKU9 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nlrp1aQ2LKU9 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nlrp1aQ2LKU9 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nlrp1aQ2LKU9 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nlrp1aQ2LKU9 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nlrp1aQ2LKU9 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nlrp1aQ2LKU9 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nlrp1aQ2LKU9 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nlrp1aQ2LKU9 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nlrp1aQ2LKU9 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nlrp1aQ2LKU9 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nlrp1aQ2LKU9 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Nlrp1aQ2LKU9 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nlrp1aQ2LKU9 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Nlrp1aQ2LKU9 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nlrp1aQ2LKU9 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nlrp1aQ2LKU9 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nlrp1aQ2LKU9 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nlrp1aQ2LKU9 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nlrp1aQ2LKU9 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nlrp1aQ2LKU9 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nlrp1aQ2LKU9 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nlrp1aQ2LKU9 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nlrp1aQ2LKU9 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nlrp1aQ2LKU9 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nlrp1aQ2LKU9 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nlrp1aQ2LKU9 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nlrp1aQ2LKU9 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nlrp1aQ2LKU9 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nlrp1aQ2LKU9 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nlrp1aQ2LKU9 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nlrp1aQ2LKU9 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Nlrp1aQ2LKU9 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nlrp1aQ2LKU9 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nlrp1aQ2LKU9 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nlrp1aQ2LKU9 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nlrp1aQ2LKU9 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nlrp1aQ2LKU9 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nlrp1aQ2LKU9 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nlrp1aQ2LKU9 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nlrp1aQ2LKU9 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nlrp1aQ2LKU9 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nlrp1aQ2LKU9 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nlrp1aQ2LKU9 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nlrp1aQ2LKU9 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nlrp1aQ2LKU9 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nlrp1aQ2LKU9 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nlrp1aQ2LKU9 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Nlrp1aQ2LKU9 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nlrp1aQ2LKU9 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nlrp1aQ2LKU9 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nlrp1aQ2LKU9 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nlrp1aQ2LKU9 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nlrp1aQ2LKU9 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nlrp1aQ2LKU9 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nlrp1aQ2LKU9 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nlrp1aQ2LKU9 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nlrp1aQ2LKU9 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nlrp1aQ2LKU9 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nlrp1aQ2LKU9 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nlrp1aQ2LKU9 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Nlrp1aQ2LKU9 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nlrp1aQ2LKU9 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Nlrp1aQ2LKU9 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nlrp1aQ2LKU9 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nlrp1aQ2LKU9 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nlrp1aQ2LKU9 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Nlrp1aQ2LKU9 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Nlrp1aQ2LKU9 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Nlrp1aQ2LKU9 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Nlrp1aQ2LKU9 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nlrp1aQ2LKU9 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nlrp1aQ2LKU9 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nlrp1aQ2LKU9 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nlrp1aQ2LKU9 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nlrp1aQ2LKU9 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nlrp1aQ2LKU9 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nlrp1aQ2LKU9 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Nlrp1aQ2LKU9 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nlrp1aQ2LKU9 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nlrp1aQ2LKU9 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nlrp1aQ2LKU9 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nlrp1aQ2LKU9 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nlrp1aQ2LKU9 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nlrp1aQ2LKU9 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nlrp1aQ2LKU9 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nlrp1aQ2LKU9 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Nlrp1aQ2LKU9 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nlrp1aQ2LKU9 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms