Protein–RNA interactions for Protein: Q1W617

Shroom4, Protein Shroom4, mousemouse

Predictions only

Length 1,475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Shroom4Q1W617 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Shroom4Q1W617 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Shroom4Q1W617 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Shroom4Q1W617 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Shroom4Q1W617 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Shroom4Q1W617 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Shroom4Q1W617 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Shroom4Q1W617 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Shroom4Q1W617 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Shroom4Q1W617 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Shroom4Q1W617 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Shroom4Q1W617 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Shroom4Q1W617 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Shroom4Q1W617 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Shroom4Q1W617 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Shroom4Q1W617 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Shroom4Q1W617 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Shroom4Q1W617 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Shroom4Q1W617 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
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