Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trim71Q1PSW8 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trim71Q1PSW8 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trim71Q1PSW8 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trim71Q1PSW8 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trim71Q1PSW8 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trim71Q1PSW8 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Trim71Q1PSW8 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trim71Q1PSW8 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trim71Q1PSW8 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trim71Q1PSW8 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trim71Q1PSW8 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trim71Q1PSW8 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trim71Q1PSW8 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trim71Q1PSW8 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trim71Q1PSW8 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trim71Q1PSW8 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trim71Q1PSW8 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trim71Q1PSW8 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trim71Q1PSW8 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trim71Q1PSW8 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trim71Q1PSW8 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trim71Q1PSW8 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trim71Q1PSW8 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trim71Q1PSW8 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trim71Q1PSW8 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Trim71Q1PSW8 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trim71Q1PSW8 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trim71Q1PSW8 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trim71Q1PSW8 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trim71Q1PSW8 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trim71Q1PSW8 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trim71Q1PSW8 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trim71Q1PSW8 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trim71Q1PSW8 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trim71Q1PSW8 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trim71Q1PSW8 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trim71Q1PSW8 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trim71Q1PSW8 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trim71Q1PSW8 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trim71Q1PSW8 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trim71Q1PSW8 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trim71Q1PSW8 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trim71Q1PSW8 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trim71Q1PSW8 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trim71Q1PSW8 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trim71Q1PSW8 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Trim71Q1PSW8 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Trim71Q1PSW8 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Trim71Q1PSW8 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Trim71Q1PSW8 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Trim71Q1PSW8 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trim71Q1PSW8 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Trim71Q1PSW8 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trim71Q1PSW8 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trim71Q1PSW8 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Trim71Q1PSW8 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trim71Q1PSW8 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trim71Q1PSW8 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trim71Q1PSW8 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Trim71Q1PSW8 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trim71Q1PSW8 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trim71Q1PSW8 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trim71Q1PSW8 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trim71Q1PSW8 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Trim71Q1PSW8 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trim71Q1PSW8 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trim71Q1PSW8 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trim71Q1PSW8 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trim71Q1PSW8 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trim71Q1PSW8 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trim71Q1PSW8 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trim71Q1PSW8 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trim71Q1PSW8 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trim71Q1PSW8 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trim71Q1PSW8 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trim71Q1PSW8 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trim71Q1PSW8 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trim71Q1PSW8 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trim71Q1PSW8 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trim71Q1PSW8 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trim71Q1PSW8 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trim71Q1PSW8 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trim71Q1PSW8 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trim71Q1PSW8 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trim71Q1PSW8 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Trim71Q1PSW8 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trim71Q1PSW8 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trim71Q1PSW8 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trim71Q1PSW8 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trim71Q1PSW8 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trim71Q1PSW8 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trim71Q1PSW8 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trim71Q1PSW8 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trim71Q1PSW8 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trim71Q1PSW8 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trim71Q1PSW8 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trim71Q1PSW8 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trim71Q1PSW8 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trim71Q1PSW8 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
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