Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGT2

Gli2, Zinc finger protein GLI2, mousemouse

Predictions only

Length 1,544 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli2Q0VGT2 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gli2Q0VGT2 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gli2Q0VGT2 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gli2Q0VGT2 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gli2Q0VGT2 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gli2Q0VGT2 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gli2Q0VGT2 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gli2Q0VGT2 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gli2Q0VGT2 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gli2Q0VGT2 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gli2Q0VGT2 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gli2Q0VGT2 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gli2Q0VGT2 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Gli2Q0VGT2 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gli2Q0VGT2 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gli2Q0VGT2 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gli2Q0VGT2 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Gli2Q0VGT2 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gli2Q0VGT2 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gli2Q0VGT2 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gli2Q0VGT2 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
Gli2Q0VGT2 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Gli2Q0VGT2 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Gli2Q0VGT2 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gli2Q0VGT2 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gli2Q0VGT2 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gli2Q0VGT2 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gli2Q0VGT2 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gli2Q0VGT2 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gli2Q0VGT2 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gli2Q0VGT2 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Gli2Q0VGT2 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gli2Q0VGT2 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gli2Q0VGT2 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gli2Q0VGT2 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gli2Q0VGT2 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gli2Q0VGT2 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gli2Q0VGT2 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gli2Q0VGT2 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gli2Q0VGT2 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gli2Q0VGT2 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Gli2Q0VGT2 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gli2Q0VGT2 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gli2Q0VGT2 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gli2Q0VGT2 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gli2Q0VGT2 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Gli2Q0VGT2 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gli2Q0VGT2 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gli2Q0VGT2 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gli2Q0VGT2 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gli2Q0VGT2 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gli2Q0VGT2 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Gli2Q0VGT2 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gli2Q0VGT2 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Gli2Q0VGT2 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gli2Q0VGT2 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Gli2Q0VGT2 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gli2Q0VGT2 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gli2Q0VGT2 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gli2Q0VGT2 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gli2Q0VGT2 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gli2Q0VGT2 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gli2Q0VGT2 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gli2Q0VGT2 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gli2Q0VGT2 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Gli2Q0VGT2 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gli2Q0VGT2 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gli2Q0VGT2 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gli2Q0VGT2 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gli2Q0VGT2 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gli2Q0VGT2 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gli2Q0VGT2 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gli2Q0VGT2 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gli2Q0VGT2 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gli2Q0VGT2 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gli2Q0VGT2 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Gli2Q0VGT2 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gli2Q0VGT2 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Gli2Q0VGT2 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Gli2Q0VGT2 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Gli2Q0VGT2 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Gli2Q0VGT2 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Gli2Q0VGT2 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gli2Q0VGT2 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gli2Q0VGT2 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gli2Q0VGT2 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gli2Q0VGT2 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gli2Q0VGT2 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gli2Q0VGT2 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gli2Q0VGT2 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gli2Q0VGT2 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gli2Q0VGT2 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gli2Q0VGT2 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gli2Q0VGT2 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gli2Q0VGT2 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gli2Q0VGT2 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gli2Q0VGT2 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Gli2Q0VGT2 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gli2Q0VGT2 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gli2Q0VGT2 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms