Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG85

Ccdc162p, Coiled-coil domain-containing protein 162, mousemouse

Predictions only

Length 912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc162pQ0VG85 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc162pQ0VG85 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc162pQ0VG85 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc162pQ0VG85 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc162pQ0VG85 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc162pQ0VG85 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc162pQ0VG85 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc162pQ0VG85 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc162pQ0VG85 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc162pQ0VG85 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc162pQ0VG85 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc162pQ0VG85 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc162pQ0VG85 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc162pQ0VG85 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ccdc162pQ0VG85 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
Ccdc162pQ0VG85 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ccdc162pQ0VG85 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ccdc162pQ0VG85 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ccdc162pQ0VG85 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ccdc162pQ0VG85 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc162pQ0VG85 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc162pQ0VG85 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc162pQ0VG85 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc162pQ0VG85 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc162pQ0VG85 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc162pQ0VG85 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc162pQ0VG85 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc162pQ0VG85 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc162pQ0VG85 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc162pQ0VG85 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc162pQ0VG85 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc162pQ0VG85 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc162pQ0VG85 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc162pQ0VG85 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc162pQ0VG85 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc162pQ0VG85 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc162pQ0VG85 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc162pQ0VG85 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc162pQ0VG85 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc162pQ0VG85 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc162pQ0VG85 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc162pQ0VG85 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc162pQ0VG85 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc162pQ0VG85 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc162pQ0VG85 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc162pQ0VG85 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc162pQ0VG85 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc162pQ0VG85 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc162pQ0VG85 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc162pQ0VG85 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc162pQ0VG85 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc162pQ0VG85 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc162pQ0VG85 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc162pQ0VG85 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc162pQ0VG85 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc162pQ0VG85 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc162pQ0VG85 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc162pQ0VG85 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc162pQ0VG85 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc162pQ0VG85 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc162pQ0VG85 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc162pQ0VG85 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc162pQ0VG85 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc162pQ0VG85 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc162pQ0VG85 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc162pQ0VG85 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc162pQ0VG85 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc162pQ0VG85 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc162pQ0VG85 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc162pQ0VG85 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc162pQ0VG85 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc162pQ0VG85 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc162pQ0VG85 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc162pQ0VG85 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc162pQ0VG85 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc162pQ0VG85 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc162pQ0VG85 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc162pQ0VG85 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc162pQ0VG85 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc162pQ0VG85 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc162pQ0VG85 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc162pQ0VG85 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc162pQ0VG85 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc162pQ0VG85 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc162pQ0VG85 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc162pQ0VG85 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc162pQ0VG85 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc162pQ0VG85 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc162pQ0VG85 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc162pQ0VG85 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc162pQ0VG85 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc162pQ0VG85 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc162pQ0VG85 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc162pQ0VG85 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc162pQ0VG85 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc162pQ0VG85 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc162pQ0VG85 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc162pQ0VG85 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc162pQ0VG85 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc162pQ0VG85 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms