Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF94

Nkpd1, NTPase KAP family P-loop domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 599 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkpd1Q0VF94 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nkpd1Q0VF94 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nkpd1Q0VF94 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nkpd1Q0VF94 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nkpd1Q0VF94 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nkpd1Q0VF94 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nkpd1Q0VF94 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Nkpd1Q0VF94 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nkpd1Q0VF94 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nkpd1Q0VF94 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nkpd1Q0VF94 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nkpd1Q0VF94 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nkpd1Q0VF94 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nkpd1Q0VF94 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nkpd1Q0VF94 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Nkpd1Q0VF94 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nkpd1Q0VF94 Gm43356-201ENSMUST00000196582 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nkpd1Q0VF94 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Nkpd1Q0VF94 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Nkpd1Q0VF94 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nkpd1Q0VF94 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nkpd1Q0VF94 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nkpd1Q0VF94 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nkpd1Q0VF94 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nkpd1Q0VF94 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nkpd1Q0VF94 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nkpd1Q0VF94 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nkpd1Q0VF94 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nkpd1Q0VF94 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nkpd1Q0VF94 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Nkpd1Q0VF94 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nkpd1Q0VF94 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nkpd1Q0VF94 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nkpd1Q0VF94 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nkpd1Q0VF94 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Nkpd1Q0VF94 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nkpd1Q0VF94 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nkpd1Q0VF94 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nkpd1Q0VF94 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nkpd1Q0VF94 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nkpd1Q0VF94 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nkpd1Q0VF94 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nkpd1Q0VF94 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nkpd1Q0VF94 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nkpd1Q0VF94 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nkpd1Q0VF94 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nkpd1Q0VF94 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nkpd1Q0VF94 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nkpd1Q0VF94 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Nkpd1Q0VF94 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nkpd1Q0VF94 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nkpd1Q0VF94 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nkpd1Q0VF94 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nkpd1Q0VF94 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nkpd1Q0VF94 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nkpd1Q0VF94 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nkpd1Q0VF94 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nkpd1Q0VF94 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nkpd1Q0VF94 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nkpd1Q0VF94 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nkpd1Q0VF94 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nkpd1Q0VF94 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nkpd1Q0VF94 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nkpd1Q0VF94 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nkpd1Q0VF94 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nkpd1Q0VF94 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nkpd1Q0VF94 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nkpd1Q0VF94 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nkpd1Q0VF94 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nkpd1Q0VF94 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nkpd1Q0VF94 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Nkpd1Q0VF94 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Nkpd1Q0VF94 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Nkpd1Q0VF94 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nkpd1Q0VF94 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nkpd1Q0VF94 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nkpd1Q0VF94 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nkpd1Q0VF94 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nkpd1Q0VF94 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nkpd1Q0VF94 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nkpd1Q0VF94 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nkpd1Q0VF94 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nkpd1Q0VF94 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nkpd1Q0VF94 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nkpd1Q0VF94 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nkpd1Q0VF94 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nkpd1Q0VF94 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nkpd1Q0VF94 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nkpd1Q0VF94 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nkpd1Q0VF94 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Nkpd1Q0VF94 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nkpd1Q0VF94 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Nkpd1Q0VF94 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nkpd1Q0VF94 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nkpd1Q0VF94 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nkpd1Q0VF94 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nkpd1Q0VF94 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nkpd1Q0VF94 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nkpd1Q0VF94 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nkpd1Q0VF94 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms