Protein–RNA interactions for Protein: Q0VE29

Samd12, Sterile alpha motif domain-containing protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd12Q0VE29 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Samd12Q0VE29 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Samd12Q0VE29 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Samd12Q0VE29 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Samd12Q0VE29 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Samd12Q0VE29 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Samd12Q0VE29 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Samd12Q0VE29 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Samd12Q0VE29 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Samd12Q0VE29 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Samd12Q0VE29 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Samd12Q0VE29 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Samd12Q0VE29 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Samd12Q0VE29 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Samd12Q0VE29 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Samd12Q0VE29 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Samd12Q0VE29 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Samd12Q0VE29 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Samd12Q0VE29 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Samd12Q0VE29 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Samd12Q0VE29 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Samd12Q0VE29 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Samd12Q0VE29 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Samd12Q0VE29 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Samd12Q0VE29 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Samd12Q0VE29 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Samd12Q0VE29 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Samd12Q0VE29 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Samd12Q0VE29 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Samd12Q0VE29 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Samd12Q0VE29 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Samd12Q0VE29 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Samd12Q0VE29 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Samd12Q0VE29 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Samd12Q0VE29 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Samd12Q0VE29 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Samd12Q0VE29 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Samd12Q0VE29 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Samd12Q0VE29 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Samd12Q0VE29 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Samd12Q0VE29 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Samd12Q0VE29 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Samd12Q0VE29 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Samd12Q0VE29 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Samd12Q0VE29 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Samd12Q0VE29 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Samd12Q0VE29 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Samd12Q0VE29 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Samd12Q0VE29 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Samd12Q0VE29 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Samd12Q0VE29 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Samd12Q0VE29 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Samd12Q0VE29 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Samd12Q0VE29 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Samd12Q0VE29 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Samd12Q0VE29 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Samd12Q0VE29 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Samd12Q0VE29 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Samd12Q0VE29 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Samd12Q0VE29 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Samd12Q0VE29 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Samd12Q0VE29 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Samd12Q0VE29 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Samd12Q0VE29 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Samd12Q0VE29 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Samd12Q0VE29 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Samd12Q0VE29 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Samd12Q0VE29 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Samd12Q0VE29 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Samd12Q0VE29 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Samd12Q0VE29 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Samd12Q0VE29 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Samd12Q0VE29 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Samd12Q0VE29 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Samd12Q0VE29 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Samd12Q0VE29 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Samd12Q0VE29 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Samd12Q0VE29 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Samd12Q0VE29 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Samd12Q0VE29 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Samd12Q0VE29 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Samd12Q0VE29 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Samd12Q0VE29 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Samd12Q0VE29 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Samd12Q0VE29 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Samd12Q0VE29 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Samd12Q0VE29 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Samd12Q0VE29 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Samd12Q0VE29 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Samd12Q0VE29 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Samd12Q0VE29 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Samd12Q0VE29 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Samd12Q0VE29 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Samd12Q0VE29 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Samd12Q0VE29 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Samd12Q0VE29 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Samd12Q0VE29 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Samd12Q0VE29 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Samd12Q0VE29 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Samd12Q0VE29 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms