Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Rundc1Q0VDN7 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rundc1Q0VDN7 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Rundc1Q0VDN7 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Rundc1Q0VDN7 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rundc1Q0VDN7 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rundc1Q0VDN7 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rundc1Q0VDN7 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rundc1Q0VDN7 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Rundc1Q0VDN7 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rundc1Q0VDN7 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rundc1Q0VDN7 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rundc1Q0VDN7 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rundc1Q0VDN7 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rundc1Q0VDN7 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rundc1Q0VDN7 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rundc1Q0VDN7 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rundc1Q0VDN7 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rundc1Q0VDN7 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rundc1Q0VDN7 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Rundc1Q0VDN7 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rundc1Q0VDN7 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rundc1Q0VDN7 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rundc1Q0VDN7 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rundc1Q0VDN7 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rundc1Q0VDN7 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rundc1Q0VDN7 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rundc1Q0VDN7 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rundc1Q0VDN7 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rundc1Q0VDN7 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rundc1Q0VDN7 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rundc1Q0VDN7 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rundc1Q0VDN7 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rundc1Q0VDN7 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rundc1Q0VDN7 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rundc1Q0VDN7 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rundc1Q0VDN7 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rundc1Q0VDN7 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Rundc1Q0VDN7 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rundc1Q0VDN7 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rundc1Q0VDN7 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rundc1Q0VDN7 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rundc1Q0VDN7 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rundc1Q0VDN7 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rundc1Q0VDN7 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rundc1Q0VDN7 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rundc1Q0VDN7 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rundc1Q0VDN7 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rundc1Q0VDN7 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rundc1Q0VDN7 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rundc1Q0VDN7 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rundc1Q0VDN7 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rundc1Q0VDN7 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rundc1Q0VDN7 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rundc1Q0VDN7 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rundc1Q0VDN7 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rundc1Q0VDN7 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rundc1Q0VDN7 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rundc1Q0VDN7 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rundc1Q0VDN7 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rundc1Q0VDN7 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rundc1Q0VDN7 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rundc1Q0VDN7 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rundc1Q0VDN7 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Rundc1Q0VDN7 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Rundc1Q0VDN7 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rundc1Q0VDN7 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rundc1Q0VDN7 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rundc1Q0VDN7 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rundc1Q0VDN7 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rundc1Q0VDN7 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rundc1Q0VDN7 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rundc1Q0VDN7 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rundc1Q0VDN7 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rundc1Q0VDN7 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rundc1Q0VDN7 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rundc1Q0VDN7 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rundc1Q0VDN7 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rundc1Q0VDN7 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rundc1Q0VDN7 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rundc1Q0VDN7 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rundc1Q0VDN7 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rundc1Q0VDN7 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rundc1Q0VDN7 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rundc1Q0VDN7 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rundc1Q0VDN7 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rundc1Q0VDN7 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rundc1Q0VDN7 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rundc1Q0VDN7 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rundc1Q0VDN7 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rundc1Q0VDN7 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rundc1Q0VDN7 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rundc1Q0VDN7 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rundc1Q0VDN7 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rundc1Q0VDN7 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rundc1Q0VDN7 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rundc1Q0VDN7 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rundc1Q0VDN7 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rundc1Q0VDN7 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Rundc1Q0VDN7 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms