Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBD0

Itgb8, Integrin beta, mousemouse

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb8Q0VBD0 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Itgb8Q0VBD0 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Itgb8Q0VBD0 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Itgb8Q0VBD0 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Itgb8Q0VBD0 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Itgb8Q0VBD0 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Itgb8Q0VBD0 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Itgb8Q0VBD0 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Itgb8Q0VBD0 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Itgb8Q0VBD0 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Itgb8Q0VBD0 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Itgb8Q0VBD0 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Itgb8Q0VBD0 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Itgb8Q0VBD0 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Itgb8Q0VBD0 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Itgb8Q0VBD0 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Itgb8Q0VBD0 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Itgb8Q0VBD0 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Itgb8Q0VBD0 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Itgb8Q0VBD0 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Itgb8Q0VBD0 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Itgb8Q0VBD0 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Itgb8Q0VBD0 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Itgb8Q0VBD0 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Itgb8Q0VBD0 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Itgb8Q0VBD0 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Itgb8Q0VBD0 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Itgb8Q0VBD0 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Itgb8Q0VBD0 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Itgb8Q0VBD0 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Itgb8Q0VBD0 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Itgb8Q0VBD0 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Itgb8Q0VBD0 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Itgb8Q0VBD0 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Itgb8Q0VBD0 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Itgb8Q0VBD0 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Itgb8Q0VBD0 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Itgb8Q0VBD0 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Itgb8Q0VBD0 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Itgb8Q0VBD0 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Itgb8Q0VBD0 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Itgb8Q0VBD0 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Itgb8Q0VBD0 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Itgb8Q0VBD0 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Itgb8Q0VBD0 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Itgb8Q0VBD0 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Itgb8Q0VBD0 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Itgb8Q0VBD0 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Itgb8Q0VBD0 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Itgb8Q0VBD0 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Itgb8Q0VBD0 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Itgb8Q0VBD0 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Itgb8Q0VBD0 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itgb8Q0VBD0 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itgb8Q0VBD0 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itgb8Q0VBD0 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itgb8Q0VBD0 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itgb8Q0VBD0 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itgb8Q0VBD0 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itgb8Q0VBD0 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itgb8Q0VBD0 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itgb8Q0VBD0 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itgb8Q0VBD0 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itgb8Q0VBD0 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itgb8Q0VBD0 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itgb8Q0VBD0 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Itgb8Q0VBD0 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itgb8Q0VBD0 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itgb8Q0VBD0 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itgb8Q0VBD0 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itgb8Q0VBD0 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itgb8Q0VBD0 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itgb8Q0VBD0 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itgb8Q0VBD0 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itgb8Q0VBD0 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itgb8Q0VBD0 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itgb8Q0VBD0 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itgb8Q0VBD0 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itgb8Q0VBD0 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itgb8Q0VBD0 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Itgb8Q0VBD0 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Itgb8Q0VBD0 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itgb8Q0VBD0 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itgb8Q0VBD0 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itgb8Q0VBD0 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itgb8Q0VBD0 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itgb8Q0VBD0 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itgb8Q0VBD0 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itgb8Q0VBD0 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itgb8Q0VBD0 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itgb8Q0VBD0 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itgb8Q0VBD0 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itgb8Q0VBD0 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itgb8Q0VBD0 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itgb8Q0VBD0 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itgb8Q0VBD0 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itgb8Q0VBD0 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itgb8Q0VBD0 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itgb8Q0VBD0 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itgb8Q0VBD0 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms