Protein–RNA interactions for Protein: Q0PD08

Rab42, Ras-related protein Rab-42, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab42Q0PD08 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab42Q0PD08 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab42Q0PD08 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab42Q0PD08 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab42Q0PD08 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab42Q0PD08 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab42Q0PD08 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab42Q0PD08 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab42Q0PD08 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab42Q0PD08 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab42Q0PD08 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab42Q0PD08 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab42Q0PD08 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab42Q0PD08 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab42Q0PD08 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab42Q0PD08 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab42Q0PD08 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab42Q0PD08 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab42Q0PD08 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab42Q0PD08 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab42Q0PD08 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab42Q0PD08 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab42Q0PD08 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab42Q0PD08 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab42Q0PD08 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab42Q0PD08 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab42Q0PD08 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab42Q0PD08 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab42Q0PD08 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab42Q0PD08 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab42Q0PD08 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab42Q0PD08 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab42Q0PD08 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab42Q0PD08 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab42Q0PD08 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab42Q0PD08 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab42Q0PD08 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab42Q0PD08 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab42Q0PD08 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab42Q0PD08 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab42Q0PD08 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab42Q0PD08 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab42Q0PD08 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab42Q0PD08 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab42Q0PD08 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab42Q0PD08 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab42Q0PD08 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab42Q0PD08 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab42Q0PD08 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab42Q0PD08 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab42Q0PD08 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab42Q0PD08 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab42Q0PD08 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab42Q0PD08 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab42Q0PD08 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab42Q0PD08 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab42Q0PD08 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab42Q0PD08 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab42Q0PD08 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab42Q0PD08 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab42Q0PD08 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab42Q0PD08 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab42Q0PD08 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab42Q0PD08 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab42Q0PD08 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab42Q0PD08 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab42Q0PD08 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab42Q0PD08 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab42Q0PD08 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab42Q0PD08 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab42Q0PD08 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab42Q0PD08 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab42Q0PD08 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab42Q0PD08 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab42Q0PD08 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab42Q0PD08 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab42Q0PD08 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab42Q0PD08 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab42Q0PD08 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab42Q0PD08 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab42Q0PD08 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab42Q0PD08 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab42Q0PD08 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab42Q0PD08 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab42Q0PD08 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab42Q0PD08 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab42Q0PD08 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab42Q0PD08 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab42Q0PD08 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab42Q0PD08 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab42Q0PD08 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab42Q0PD08 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab42Q0PD08 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab42Q0PD08 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab42Q0PD08 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab42Q0PD08 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab42Q0PD08 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab42Q0PD08 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab42Q0PD08 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab42Q0PD08 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms