Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ttc21bQ0HA38 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ttc21bQ0HA38 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ttc21bQ0HA38 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ttc21bQ0HA38 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ttc21bQ0HA38 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ttc21bQ0HA38 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ttc21bQ0HA38 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ttc21bQ0HA38 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ttc21bQ0HA38 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ttc21bQ0HA38 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ttc21bQ0HA38 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ttc21bQ0HA38 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ttc21bQ0HA38 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ttc21bQ0HA38 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ttc21bQ0HA38 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ttc21bQ0HA38 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Ttc21bQ0HA38 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ttc21bQ0HA38 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ttc21bQ0HA38 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ttc21bQ0HA38 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ttc21bQ0HA38 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ttc21bQ0HA38 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ttc21bQ0HA38 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ttc21bQ0HA38 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ttc21bQ0HA38 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ttc21bQ0HA38 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ttc21bQ0HA38 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ttc21bQ0HA38 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ttc21bQ0HA38 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ttc21bQ0HA38 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ttc21bQ0HA38 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ttc21bQ0HA38 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ttc21bQ0HA38 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ttc21bQ0HA38 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ttc21bQ0HA38 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ttc21bQ0HA38 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ttc21bQ0HA38 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ttc21bQ0HA38 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ttc21bQ0HA38 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ttc21bQ0HA38 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ttc21bQ0HA38 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ttc21bQ0HA38 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ttc21bQ0HA38 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ttc21bQ0HA38 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ttc21bQ0HA38 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ttc21bQ0HA38 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ttc21bQ0HA38 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Ttc21bQ0HA38 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ttc21bQ0HA38 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ttc21bQ0HA38 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ttc21bQ0HA38 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ttc21bQ0HA38 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ttc21bQ0HA38 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ttc21bQ0HA38 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ttc21bQ0HA38 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ttc21bQ0HA38 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Ttc21bQ0HA38 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ttc21bQ0HA38 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ttc21bQ0HA38 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ttc21bQ0HA38 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ttc21bQ0HA38 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ttc21bQ0HA38 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ttc21bQ0HA38 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ttc21bQ0HA38 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ttc21bQ0HA38 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ttc21bQ0HA38 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ttc21bQ0HA38 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ttc21bQ0HA38 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ttc21bQ0HA38 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ttc21bQ0HA38 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ttc21bQ0HA38 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ttc21bQ0HA38 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ttc21bQ0HA38 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ttc21bQ0HA38 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ttc21bQ0HA38 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ttc21bQ0HA38 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ttc21bQ0HA38 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ttc21bQ0HA38 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ttc21bQ0HA38 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ttc21bQ0HA38 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ttc21bQ0HA38 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ttc21bQ0HA38 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ttc21bQ0HA38 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ttc21bQ0HA38 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ttc21bQ0HA38 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ttc21bQ0HA38 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ttc21bQ0HA38 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ttc21bQ0HA38 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ttc21bQ0HA38 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ttc21bQ0HA38 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ttc21bQ0HA38 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ttc21bQ0HA38 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ttc21bQ0HA38 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ttc21bQ0HA38 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ttc21bQ0HA38 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ttc21bQ0HA38 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ttc21bQ0HA38 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ttc21bQ0HA38 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Ttc21bQ0HA38 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms