Protein–RNA interactions for Protein: Q0GGX2

Znf541, Zinc finger protein 541, mousemouse

Predictions only

Length 1,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf541Q0GGX2 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Znf541Q0GGX2 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Znf541Q0GGX2 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Znf541Q0GGX2 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Znf541Q0GGX2 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Znf541Q0GGX2 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Znf541Q0GGX2 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Znf541Q0GGX2 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Znf541Q0GGX2 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Znf541Q0GGX2 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Znf541Q0GGX2 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Znf541Q0GGX2 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Znf541Q0GGX2 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Znf541Q0GGX2 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Znf541Q0GGX2 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Znf541Q0GGX2 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Znf541Q0GGX2 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Znf541Q0GGX2 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Znf541Q0GGX2 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Znf541Q0GGX2 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Znf541Q0GGX2 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Znf541Q0GGX2 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Znf541Q0GGX2 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Znf541Q0GGX2 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Znf541Q0GGX2 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Znf541Q0GGX2 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Znf541Q0GGX2 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Znf541Q0GGX2 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Znf541Q0GGX2 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Znf541Q0GGX2 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Znf541Q0GGX2 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Znf541Q0GGX2 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Znf541Q0GGX2 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Znf541Q0GGX2 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Znf541Q0GGX2 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Znf541Q0GGX2 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Znf541Q0GGX2 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Znf541Q0GGX2 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Znf541Q0GGX2 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Znf541Q0GGX2 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Znf541Q0GGX2 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Znf541Q0GGX2 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Znf541Q0GGX2 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Znf541Q0GGX2 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Znf541Q0GGX2 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Znf541Q0GGX2 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Znf541Q0GGX2 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Znf541Q0GGX2 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Znf541Q0GGX2 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Znf541Q0GGX2 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Znf541Q0GGX2 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Znf541Q0GGX2 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Znf541Q0GGX2 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Znf541Q0GGX2 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Znf541Q0GGX2 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Znf541Q0GGX2 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Znf541Q0GGX2 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Znf541Q0GGX2 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Znf541Q0GGX2 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Znf541Q0GGX2 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Znf541Q0GGX2 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Znf541Q0GGX2 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Znf541Q0GGX2 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Znf541Q0GGX2 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Znf541Q0GGX2 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Znf541Q0GGX2 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Znf541Q0GGX2 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Znf541Q0GGX2 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Znf541Q0GGX2 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Znf541Q0GGX2 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Znf541Q0GGX2 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Znf541Q0GGX2 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Znf541Q0GGX2 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Znf541Q0GGX2 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Znf541Q0GGX2 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Znf541Q0GGX2 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Znf541Q0GGX2 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Znf541Q0GGX2 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Znf541Q0GGX2 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Znf541Q0GGX2 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Znf541Q0GGX2 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Znf541Q0GGX2 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Znf541Q0GGX2 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Znf541Q0GGX2 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Znf541Q0GGX2 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Znf541Q0GGX2 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Znf541Q0GGX2 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Znf541Q0GGX2 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Znf541Q0GGX2 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Znf541Q0GGX2 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Znf541Q0GGX2 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Znf541Q0GGX2 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Znf541Q0GGX2 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Znf541Q0GGX2 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Znf541Q0GGX2 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Znf541Q0GGX2 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Znf541Q0GGX2 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Znf541Q0GGX2 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Znf541Q0GGX2 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Znf541Q0GGX2 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.4 ms