Protein–RNA interactions for Protein: Q08624

Hoxc4, Homeobox protein Hox-C4, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc4Q08624 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxc4Q08624 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxc4Q08624 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxc4Q08624 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxc4Q08624 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxc4Q08624 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxc4Q08624 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxc4Q08624 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxc4Q08624 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxc4Q08624 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxc4Q08624 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxc4Q08624 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxc4Q08624 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxc4Q08624 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxc4Q08624 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxc4Q08624 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxc4Q08624 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxc4Q08624 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxc4Q08624 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxc4Q08624 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxc4Q08624 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxc4Q08624 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxc4Q08624 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxc4Q08624 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxc4Q08624 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxc4Q08624 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxc4Q08624 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxc4Q08624 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxc4Q08624 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxc4Q08624 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxc4Q08624 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxc4Q08624 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxc4Q08624 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxc4Q08624 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxc4Q08624 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxc4Q08624 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxc4Q08624 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxc4Q08624 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxc4Q08624 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxc4Q08624 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxc4Q08624 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxc4Q08624 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxc4Q08624 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxc4Q08624 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxc4Q08624 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxc4Q08624 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxc4Q08624 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxc4Q08624 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxc4Q08624 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxc4Q08624 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxc4Q08624 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxc4Q08624 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxc4Q08624 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxc4Q08624 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxc4Q08624 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxc4Q08624 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxc4Q08624 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxc4Q08624 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxc4Q08624 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxc4Q08624 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxc4Q08624 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxc4Q08624 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxc4Q08624 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxc4Q08624 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxc4Q08624 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxc4Q08624 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxc4Q08624 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxc4Q08624 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxc4Q08624 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxc4Q08624 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxc4Q08624 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxc4Q08624 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hoxc4Q08624 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hoxc4Q08624 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hoxc4Q08624 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hoxc4Q08624 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hoxc4Q08624 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxc4Q08624 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxc4Q08624 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxc4Q08624 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxc4Q08624 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxc4Q08624 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxc4Q08624 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxc4Q08624 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxc4Q08624 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxc4Q08624 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxc4Q08624 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxc4Q08624 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxc4Q08624 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxc4Q08624 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxc4Q08624 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxc4Q08624 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxc4Q08624 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxc4Q08624 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxc4Q08624 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxc4Q08624 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxc4Q08624 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxc4Q08624 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxc4Q08624 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxc4Q08624 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms