Protein–RNA interactions for Protein: Q08460

Kcnma1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnma1Q08460 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Kcnma1Q08460 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Kcnma1Q08460 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Kcnma1Q08460 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Kcnma1Q08460 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Kcnma1Q08460 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Kcnma1Q08460 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Kcnma1Q08460 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Kcnma1Q08460 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Kcnma1Q08460 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Kcnma1Q08460 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Kcnma1Q08460 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Kcnma1Q08460 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Kcnma1Q08460 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Kcnma1Q08460 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Kcnma1Q08460 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Kcnma1Q08460 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Kcnma1Q08460 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Kcnma1Q08460 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Kcnma1Q08460 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Kcnma1Q08460 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Kcnma1Q08460 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Kcnma1Q08460 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Kcnma1Q08460 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Kcnma1Q08460 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Kcnma1Q08460 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Kcnma1Q08460 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Kcnma1Q08460 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Kcnma1Q08460 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Kcnma1Q08460 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Kcnma1Q08460 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Kcnma1Q08460 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Kcnma1Q08460 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Kcnma1Q08460 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Kcnma1Q08460 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Kcnma1Q08460 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Kcnma1Q08460 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Kcnma1Q08460 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Kcnma1Q08460 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Kcnma1Q08460 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Kcnma1Q08460 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Kcnma1Q08460 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Kcnma1Q08460 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Kcnma1Q08460 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Kcnma1Q08460 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Kcnma1Q08460 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Kcnma1Q08460 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Kcnma1Q08460 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Kcnma1Q08460 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Kcnma1Q08460 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Kcnma1Q08460 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Kcnma1Q08460 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Kcnma1Q08460 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Kcnma1Q08460 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Kcnma1Q08460 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Kcnma1Q08460 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Kcnma1Q08460 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Kcnma1Q08460 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Kcnma1Q08460 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Kcnma1Q08460 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Kcnma1Q08460 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Kcnma1Q08460 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Kcnma1Q08460 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Kcnma1Q08460 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Kcnma1Q08460 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Kcnma1Q08460 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Kcnma1Q08460 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Kcnma1Q08460 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Kcnma1Q08460 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Kcnma1Q08460 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Kcnma1Q08460 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Kcnma1Q08460 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Kcnma1Q08460 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Kcnma1Q08460 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Kcnma1Q08460 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Kcnma1Q08460 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Kcnma1Q08460 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Kcnma1Q08460 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Kcnma1Q08460 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Kcnma1Q08460 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Kcnma1Q08460 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Kcnma1Q08460 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Kcnma1Q08460 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Kcnma1Q08460 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Kcnma1Q08460 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Kcnma1Q08460 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Kcnma1Q08460 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Kcnma1Q08460 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Kcnma1Q08460 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Kcnma1Q08460 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Kcnma1Q08460 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Kcnma1Q08460 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Kcnma1Q08460 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Kcnma1Q08460 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Kcnma1Q08460 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Kcnma1Q08460 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Kcnma1Q08460 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Kcnma1Q08460 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Kcnma1Q08460 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Kcnma1Q08460 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms