Protein–RNA interactions for Protein: Q08369

Gata4, Transcription factor GATA-4, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata4Q08369 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Gata4Q08369 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gata4Q08369 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gata4Q08369 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gata4Q08369 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gata4Q08369 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gata4Q08369 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gata4Q08369 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gata4Q08369 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gata4Q08369 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gata4Q08369 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gata4Q08369 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gata4Q08369 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gata4Q08369 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Gata4Q08369 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gata4Q08369 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gata4Q08369 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gata4Q08369 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gata4Q08369 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gata4Q08369 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Gata4Q08369 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Gata4Q08369 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gata4Q08369 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gata4Q08369 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gata4Q08369 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gata4Q08369 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gata4Q08369 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gata4Q08369 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gata4Q08369 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gata4Q08369 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gata4Q08369 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gata4Q08369 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gata4Q08369 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gata4Q08369 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gata4Q08369 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gata4Q08369 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gata4Q08369 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Gata4Q08369 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gata4Q08369 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gata4Q08369 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gata4Q08369 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gata4Q08369 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Gata4Q08369 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Gata4Q08369 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Gata4Q08369 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gata4Q08369 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gata4Q08369 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gata4Q08369 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gata4Q08369 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gata4Q08369 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gata4Q08369 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gata4Q08369 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Gata4Q08369 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gata4Q08369 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gata4Q08369 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gata4Q08369 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gata4Q08369 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gata4Q08369 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gata4Q08369 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gata4Q08369 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gata4Q08369 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gata4Q08369 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gata4Q08369 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gata4Q08369 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Gata4Q08369 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gata4Q08369 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gata4Q08369 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gata4Q08369 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gata4Q08369 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gata4Q08369 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gata4Q08369 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gata4Q08369 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gata4Q08369 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gata4Q08369 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gata4Q08369 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gata4Q08369 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gata4Q08369 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gata4Q08369 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Gata4Q08369 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gata4Q08369 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gata4Q08369 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gata4Q08369 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gata4Q08369 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gata4Q08369 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gata4Q08369 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gata4Q08369 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gata4Q08369 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gata4Q08369 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gata4Q08369 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gata4Q08369 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gata4Q08369 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gata4Q08369 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gata4Q08369 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gata4Q08369 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gata4Q08369 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gata4Q08369 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Gata4Q08369 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gata4Q08369 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gata4Q08369 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gata4Q08369 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms