Protein–RNA interactions for Protein: Q08189

Tgm3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, mousemouse

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm3Q08189 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tgm3Q08189 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tgm3Q08189 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tgm3Q08189 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tgm3Q08189 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Tgm3Q08189 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tgm3Q08189 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tgm3Q08189 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tgm3Q08189 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tgm3Q08189 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tgm3Q08189 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tgm3Q08189 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tgm3Q08189 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tgm3Q08189 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tgm3Q08189 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tgm3Q08189 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tgm3Q08189 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tgm3Q08189 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tgm3Q08189 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tgm3Q08189 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tgm3Q08189 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tgm3Q08189 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tgm3Q08189 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tgm3Q08189 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tgm3Q08189 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tgm3Q08189 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tgm3Q08189 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tgm3Q08189 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tgm3Q08189 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tgm3Q08189 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tgm3Q08189 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tgm3Q08189 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tgm3Q08189 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tgm3Q08189 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tgm3Q08189 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tgm3Q08189 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tgm3Q08189 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Tgm3Q08189 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tgm3Q08189 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tgm3Q08189 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Tgm3Q08189 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Tgm3Q08189 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tgm3Q08189 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tgm3Q08189 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tgm3Q08189 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tgm3Q08189 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tgm3Q08189 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tgm3Q08189 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tgm3Q08189 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Tgm3Q08189 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tgm3Q08189 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tgm3Q08189 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tgm3Q08189 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tgm3Q08189 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tgm3Q08189 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tgm3Q08189 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tgm3Q08189 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tgm3Q08189 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tgm3Q08189 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tgm3Q08189 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tgm3Q08189 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tgm3Q08189 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tgm3Q08189 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tgm3Q08189 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tgm3Q08189 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tgm3Q08189 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Tgm3Q08189 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tgm3Q08189 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tgm3Q08189 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tgm3Q08189 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tgm3Q08189 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tgm3Q08189 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tgm3Q08189 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tgm3Q08189 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tgm3Q08189 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tgm3Q08189 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tgm3Q08189 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tgm3Q08189 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Tgm3Q08189 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tgm3Q08189 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tgm3Q08189 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tgm3Q08189 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tgm3Q08189 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Tgm3Q08189 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tgm3Q08189 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tgm3Q08189 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tgm3Q08189 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tgm3Q08189 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tgm3Q08189 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tgm3Q08189 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tgm3Q08189 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tgm3Q08189 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tgm3Q08189 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tgm3Q08189 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tgm3Q08189 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tgm3Q08189 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tgm3Q08189 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tgm3Q08189 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tgm3Q08189 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tgm3Q08189 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms