Protein–RNA interactions for Protein: Q07916

Pou6f1, POU domain, class 6, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou6f1Q07916 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pou6f1Q07916 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pou6f1Q07916 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pou6f1Q07916 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pou6f1Q07916 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pou6f1Q07916 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pou6f1Q07916 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pou6f1Q07916 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pou6f1Q07916 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pou6f1Q07916 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pou6f1Q07916 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pou6f1Q07916 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pou6f1Q07916 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pou6f1Q07916 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pou6f1Q07916 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pou6f1Q07916 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pou6f1Q07916 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pou6f1Q07916 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pou6f1Q07916 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pou6f1Q07916 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pou6f1Q07916 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pou6f1Q07916 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pou6f1Q07916 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pou6f1Q07916 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Pou6f1Q07916 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pou6f1Q07916 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pou6f1Q07916 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pou6f1Q07916 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pou6f1Q07916 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pou6f1Q07916 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pou6f1Q07916 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pou6f1Q07916 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pou6f1Q07916 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pou6f1Q07916 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pou6f1Q07916 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pou6f1Q07916 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pou6f1Q07916 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pou6f1Q07916 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pou6f1Q07916 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pou6f1Q07916 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pou6f1Q07916 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pou6f1Q07916 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pou6f1Q07916 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pou6f1Q07916 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pou6f1Q07916 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pou6f1Q07916 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pou6f1Q07916 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pou6f1Q07916 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pou6f1Q07916 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pou6f1Q07916 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pou6f1Q07916 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pou6f1Q07916 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pou6f1Q07916 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pou6f1Q07916 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pou6f1Q07916 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pou6f1Q07916 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pou6f1Q07916 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pou6f1Q07916 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pou6f1Q07916 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pou6f1Q07916 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pou6f1Q07916 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pou6f1Q07916 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pou6f1Q07916 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pou6f1Q07916 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pou6f1Q07916 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pou6f1Q07916 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Pou6f1Q07916 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pou6f1Q07916 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pou6f1Q07916 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pou6f1Q07916 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pou6f1Q07916 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pou6f1Q07916 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pou6f1Q07916 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pou6f1Q07916 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pou6f1Q07916 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pou6f1Q07916 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Pou6f1Q07916 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pou6f1Q07916 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pou6f1Q07916 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pou6f1Q07916 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pou6f1Q07916 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pou6f1Q07916 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Pou6f1Q07916 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Pou6f1Q07916 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Pou6f1Q07916 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pou6f1Q07916 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pou6f1Q07916 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pou6f1Q07916 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pou6f1Q07916 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pou6f1Q07916 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pou6f1Q07916 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pou6f1Q07916 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pou6f1Q07916 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pou6f1Q07916 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pou6f1Q07916 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Pou6f1Q07916 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pou6f1Q07916 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pou6f1Q07916 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Pou6f1Q07916 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pou6f1Q07916 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms