Protein–RNA interactions for Protein: Q07646

Mest, Mesoderm-specific transcript protein, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MestQ07646 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MestQ07646 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MestQ07646 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MestQ07646 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MestQ07646 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MestQ07646 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MestQ07646 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MestQ07646 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MestQ07646 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MestQ07646 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MestQ07646 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
MestQ07646 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MestQ07646 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MestQ07646 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
MestQ07646 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
MestQ07646 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MestQ07646 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MestQ07646 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MestQ07646 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MestQ07646 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MestQ07646 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MestQ07646 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MestQ07646 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MestQ07646 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MestQ07646 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MestQ07646 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MestQ07646 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
MestQ07646 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MestQ07646 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MestQ07646 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MestQ07646 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MestQ07646 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MestQ07646 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MestQ07646 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MestQ07646 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
MestQ07646 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
MestQ07646 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MestQ07646 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MestQ07646 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MestQ07646 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MestQ07646 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MestQ07646 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MestQ07646 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MestQ07646 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MestQ07646 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MestQ07646 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
MestQ07646 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
MestQ07646 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
MestQ07646 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
MestQ07646 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
MestQ07646 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
MestQ07646 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
MestQ07646 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
MestQ07646 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MestQ07646 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MestQ07646 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MestQ07646 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MestQ07646 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MestQ07646 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
MestQ07646 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MestQ07646 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MestQ07646 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MestQ07646 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MestQ07646 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MestQ07646 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MestQ07646 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MestQ07646 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MestQ07646 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MestQ07646 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MestQ07646 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MestQ07646 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MestQ07646 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MestQ07646 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MestQ07646 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MestQ07646 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MestQ07646 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MestQ07646 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MestQ07646 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MestQ07646 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MestQ07646 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MestQ07646 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MestQ07646 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MestQ07646 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MestQ07646 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MestQ07646 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MestQ07646 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MestQ07646 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MestQ07646 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MestQ07646 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MestQ07646 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MestQ07646 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MestQ07646 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MestQ07646 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MestQ07646 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MestQ07646 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MestQ07646 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MestQ07646 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MestQ07646 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MestQ07646 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MestQ07646 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms