Protein–RNA interactions for Protein: Q07104

Gdf3, Growth/differentiation factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf3Q07104 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gdf3Q07104 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gdf3Q07104 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gdf3Q07104 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gdf3Q07104 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gdf3Q07104 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gdf3Q07104 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gdf3Q07104 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gdf3Q07104 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gdf3Q07104 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gdf3Q07104 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gdf3Q07104 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gdf3Q07104 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gdf3Q07104 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gdf3Q07104 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gdf3Q07104 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gdf3Q07104 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gdf3Q07104 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gdf3Q07104 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gdf3Q07104 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gdf3Q07104 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gdf3Q07104 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gdf3Q07104 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gdf3Q07104 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gdf3Q07104 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gdf3Q07104 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gdf3Q07104 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gdf3Q07104 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gdf3Q07104 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gdf3Q07104 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gdf3Q07104 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gdf3Q07104 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gdf3Q07104 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gdf3Q07104 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gdf3Q07104 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gdf3Q07104 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gdf3Q07104 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gdf3Q07104 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gdf3Q07104 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gdf3Q07104 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gdf3Q07104 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gdf3Q07104 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gdf3Q07104 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gdf3Q07104 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gdf3Q07104 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gdf3Q07104 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gdf3Q07104 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gdf3Q07104 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gdf3Q07104 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gdf3Q07104 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gdf3Q07104 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gdf3Q07104 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gdf3Q07104 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gdf3Q07104 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gdf3Q07104 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gdf3Q07104 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gdf3Q07104 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gdf3Q07104 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gdf3Q07104 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gdf3Q07104 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gdf3Q07104 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gdf3Q07104 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gdf3Q07104 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gdf3Q07104 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gdf3Q07104 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gdf3Q07104 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gdf3Q07104 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gdf3Q07104 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gdf3Q07104 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gdf3Q07104 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gdf3Q07104 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gdf3Q07104 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gdf3Q07104 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gdf3Q07104 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gdf3Q07104 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gdf3Q07104 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gdf3Q07104 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gdf3Q07104 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gdf3Q07104 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gdf3Q07104 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gdf3Q07104 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gdf3Q07104 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gdf3Q07104 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gdf3Q07104 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gdf3Q07104 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gdf3Q07104 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gdf3Q07104 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gdf3Q07104 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gdf3Q07104 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gdf3Q07104 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gdf3Q07104 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gdf3Q07104 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gdf3Q07104 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gdf3Q07104 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gdf3Q07104 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gdf3Q07104 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gdf3Q07104 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gdf3Q07104 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gdf3Q07104 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gdf3Q07104 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms