Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Siah1bQ06985 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Siah1bQ06985 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Siah1bQ06985 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Siah1bQ06985 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Siah1bQ06985 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Siah1bQ06985 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Siah1bQ06985 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Siah1bQ06985 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Siah1bQ06985 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Siah1bQ06985 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Siah1bQ06985 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Siah1bQ06985 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Siah1bQ06985 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Siah1bQ06985 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Siah1bQ06985 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Siah1bQ06985 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Siah1bQ06985 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Siah1bQ06985 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Siah1bQ06985 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Siah1bQ06985 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Siah1bQ06985 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Siah1bQ06985 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Siah1bQ06985 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Siah1bQ06985 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Siah1bQ06985 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Siah1bQ06985 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Siah1bQ06985 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Siah1bQ06985 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Siah1bQ06985 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Siah1bQ06985 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Siah1bQ06985 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Siah1bQ06985 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Siah1bQ06985 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Siah1bQ06985 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Siah1bQ06985 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Siah1bQ06985 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Siah1bQ06985 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Siah1bQ06985 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Siah1bQ06985 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Siah1bQ06985 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Siah1bQ06985 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Siah1bQ06985 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Siah1bQ06985 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Siah1bQ06985 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Siah1bQ06985 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Siah1bQ06985 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Siah1bQ06985 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Siah1bQ06985 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Siah1bQ06985 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Siah1bQ06985 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Siah1bQ06985 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Siah1bQ06985 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Siah1bQ06985 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Siah1bQ06985 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Siah1bQ06985 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Siah1bQ06985 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Siah1bQ06985 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Siah1bQ06985 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Siah1bQ06985 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Siah1bQ06985 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Siah1bQ06985 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Siah1bQ06985 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Siah1bQ06985 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Siah1bQ06985 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Siah1bQ06985 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Siah1bQ06985 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Siah1bQ06985 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Siah1bQ06985 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Siah1bQ06985 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Siah1bQ06985 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Siah1bQ06985 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Siah1bQ06985 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Siah1bQ06985 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Siah1bQ06985 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Siah1bQ06985 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Siah1bQ06985 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Siah1bQ06985 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Siah1bQ06985 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Siah1bQ06985 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Siah1bQ06985 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Siah1bQ06985 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Siah1bQ06985 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Siah1bQ06985 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Siah1bQ06985 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Siah1bQ06985 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Siah1bQ06985 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Siah1bQ06985 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Siah1bQ06985 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Siah1bQ06985 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Siah1bQ06985 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Siah1bQ06985 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Siah1bQ06985 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Siah1bQ06985 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Siah1bQ06985 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Siah1bQ06985 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Siah1bQ06985 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Siah1bQ06985 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Siah1bQ06985 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Siah1bQ06985 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms