Protein–RNA interactions for Protein: Q06507

Atf4, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-4, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf4Q06507 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atf4Q06507 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atf4Q06507 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atf4Q06507 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atf4Q06507 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atf4Q06507 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atf4Q06507 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atf4Q06507 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atf4Q06507 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atf4Q06507 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atf4Q06507 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Atf4Q06507 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atf4Q06507 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Atf4Q06507 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atf4Q06507 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atf4Q06507 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atf4Q06507 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atf4Q06507 Gm37744-201ENSMUST00000194616 1590 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Atf4Q06507 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atf4Q06507 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atf4Q06507 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atf4Q06507 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atf4Q06507 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atf4Q06507 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atf4Q06507 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atf4Q06507 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atf4Q06507 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atf4Q06507 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atf4Q06507 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atf4Q06507 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atf4Q06507 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atf4Q06507 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atf4Q06507 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atf4Q06507 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atf4Q06507 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atf4Q06507 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atf4Q06507 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atf4Q06507 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Atf4Q06507 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Atf4Q06507 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atf4Q06507 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Atf4Q06507 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atf4Q06507 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atf4Q06507 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atf4Q06507 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atf4Q06507 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atf4Q06507 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atf4Q06507 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atf4Q06507 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atf4Q06507 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atf4Q06507 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atf4Q06507 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atf4Q06507 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atf4Q06507 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atf4Q06507 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atf4Q06507 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atf4Q06507 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atf4Q06507 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Atf4Q06507 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atf4Q06507 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atf4Q06507 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atf4Q06507 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atf4Q06507 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Atf4Q06507 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Atf4Q06507 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Atf4Q06507 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Atf4Q06507 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Atf4Q06507 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Atf4Q06507 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Atf4Q06507 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Atf4Q06507 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Atf4Q06507 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atf4Q06507 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atf4Q06507 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atf4Q06507 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atf4Q06507 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atf4Q06507 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atf4Q06507 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atf4Q06507 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atf4Q06507 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Atf4Q06507 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atf4Q06507 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atf4Q06507 Gm43371-201ENSMUST00000202838 1031 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Atf4Q06507 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atf4Q06507 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atf4Q06507 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atf4Q06507 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atf4Q06507 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atf4Q06507 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atf4Q06507 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Atf4Q06507 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Atf4Q06507 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atf4Q06507 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atf4Q06507 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atf4Q06507 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atf4Q06507 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atf4Q06507 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atf4Q06507 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atf4Q06507 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atf4Q06507 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms