Protein–RNA interactions for Protein: Q06194

F8, Coagulation factor VIII, mousemouse

Predictions only

Length 2,319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F8Q06194 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
F8Q06194 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
F8Q06194 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
F8Q06194 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
F8Q06194 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
F8Q06194 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
F8Q06194 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
F8Q06194 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
F8Q06194 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
F8Q06194 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
F8Q06194 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
F8Q06194 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
F8Q06194 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
F8Q06194 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
F8Q06194 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
F8Q06194 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
F8Q06194 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
F8Q06194 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
F8Q06194 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
F8Q06194 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
F8Q06194 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
F8Q06194 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
F8Q06194 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
F8Q06194 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
F8Q06194 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
F8Q06194 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
F8Q06194 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
F8Q06194 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
F8Q06194 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
F8Q06194 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
F8Q06194 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
F8Q06194 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
F8Q06194 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
F8Q06194 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
F8Q06194 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
F8Q06194 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
F8Q06194 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
F8Q06194 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
F8Q06194 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
F8Q06194 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
F8Q06194 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
F8Q06194 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
F8Q06194 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
F8Q06194 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
F8Q06194 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
F8Q06194 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
F8Q06194 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
F8Q06194 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
F8Q06194 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
F8Q06194 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
F8Q06194 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
F8Q06194 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
F8Q06194 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
F8Q06194 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
F8Q06194 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
F8Q06194 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
F8Q06194 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
F8Q06194 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
F8Q06194 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
F8Q06194 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
F8Q06194 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
F8Q06194 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
F8Q06194 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
F8Q06194 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
F8Q06194 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
F8Q06194 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
F8Q06194 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
F8Q06194 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
F8Q06194 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
F8Q06194 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
F8Q06194 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
F8Q06194 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
F8Q06194 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
F8Q06194 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
F8Q06194 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
F8Q06194 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
F8Q06194 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
F8Q06194 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
F8Q06194 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
F8Q06194 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
F8Q06194 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
F8Q06194 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
F8Q06194 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
F8Q06194 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
F8Q06194 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
F8Q06194 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
F8Q06194 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
F8Q06194 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
F8Q06194 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
F8Q06194 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
F8Q06194 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
F8Q06194 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
F8Q06194 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
F8Q06194 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
F8Q06194 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
F8Q06194 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
F8Q06194 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
F8Q06194 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
F8Q06194 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
F8Q06194 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms