Protein–RNA interactions for Protein: Q05895

Thbs3, Thrombospondin-3, mousemouse

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs3Q05895 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Thbs3Q05895 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Thbs3Q05895 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Thbs3Q05895 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Thbs3Q05895 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Thbs3Q05895 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Thbs3Q05895 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Thbs3Q05895 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Thbs3Q05895 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Thbs3Q05895 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Thbs3Q05895 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Thbs3Q05895 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Thbs3Q05895 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Thbs3Q05895 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Thbs3Q05895 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Thbs3Q05895 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Thbs3Q05895 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Thbs3Q05895 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Thbs3Q05895 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Thbs3Q05895 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Thbs3Q05895 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Thbs3Q05895 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Thbs3Q05895 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Thbs3Q05895 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Thbs3Q05895 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Thbs3Q05895 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Thbs3Q05895 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Thbs3Q05895 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Thbs3Q05895 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Thbs3Q05895 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Thbs3Q05895 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Thbs3Q05895 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Thbs3Q05895 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Thbs3Q05895 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Thbs3Q05895 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Thbs3Q05895 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Thbs3Q05895 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Thbs3Q05895 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Thbs3Q05895 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Thbs3Q05895 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Thbs3Q05895 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Thbs3Q05895 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Thbs3Q05895 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Thbs3Q05895 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Thbs3Q05895 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Thbs3Q05895 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Thbs3Q05895 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Thbs3Q05895 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Thbs3Q05895 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Thbs3Q05895 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Thbs3Q05895 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Thbs3Q05895 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Thbs3Q05895 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Thbs3Q05895 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Thbs3Q05895 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Thbs3Q05895 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Thbs3Q05895 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Thbs3Q05895 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Thbs3Q05895 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Thbs3Q05895 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Thbs3Q05895 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Thbs3Q05895 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Thbs3Q05895 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Thbs3Q05895 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Thbs3Q05895 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Thbs3Q05895 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Thbs3Q05895 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Thbs3Q05895 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Thbs3Q05895 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Thbs3Q05895 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Thbs3Q05895 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Thbs3Q05895 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Thbs3Q05895 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Thbs3Q05895 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Thbs3Q05895 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Thbs3Q05895 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Thbs3Q05895 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Thbs3Q05895 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Thbs3Q05895 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Thbs3Q05895 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Thbs3Q05895 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Thbs3Q05895 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Thbs3Q05895 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Thbs3Q05895 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Thbs3Q05895 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Thbs3Q05895 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Thbs3Q05895 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Thbs3Q05895 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Thbs3Q05895 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Thbs3Q05895 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Thbs3Q05895 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Thbs3Q05895 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Thbs3Q05895 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Thbs3Q05895 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Thbs3Q05895 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Thbs3Q05895 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Thbs3Q05895 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Thbs3Q05895 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Thbs3Q05895 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Thbs3Q05895 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms