Protein–RNA interactions for Protein: Q05738

Sry, Sex-determining region Y protein, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SryQ05738 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SryQ05738 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SryQ05738 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SryQ05738 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SryQ05738 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SryQ05738 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SryQ05738 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SryQ05738 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SryQ05738 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SryQ05738 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SryQ05738 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SryQ05738 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SryQ05738 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SryQ05738 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SryQ05738 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SryQ05738 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SryQ05738 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SryQ05738 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SryQ05738 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SryQ05738 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SryQ05738 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SryQ05738 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SryQ05738 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SryQ05738 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SryQ05738 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
SryQ05738 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SryQ05738 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SryQ05738 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SryQ05738 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SryQ05738 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SryQ05738 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SryQ05738 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SryQ05738 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SryQ05738 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SryQ05738 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SryQ05738 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SryQ05738 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SryQ05738 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SryQ05738 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SryQ05738 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SryQ05738 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SryQ05738 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SryQ05738 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SryQ05738 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SryQ05738 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SryQ05738 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SryQ05738 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SryQ05738 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SryQ05738 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SryQ05738 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SryQ05738 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SryQ05738 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SryQ05738 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SryQ05738 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SryQ05738 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SryQ05738 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SryQ05738 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SryQ05738 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SryQ05738 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SryQ05738 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SryQ05738 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SryQ05738 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SryQ05738 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SryQ05738 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SryQ05738 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SryQ05738 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SryQ05738 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SryQ05738 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SryQ05738 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SryQ05738 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SryQ05738 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SryQ05738 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SryQ05738 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SryQ05738 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SryQ05738 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SryQ05738 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SryQ05738 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SryQ05738 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SryQ05738 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SryQ05738 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SryQ05738 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SryQ05738 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SryQ05738 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SryQ05738 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SryQ05738 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SryQ05738 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SryQ05738 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SryQ05738 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SryQ05738 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SryQ05738 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SryQ05738 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SryQ05738 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SryQ05738 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SryQ05738 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SryQ05738 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SryQ05738 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SryQ05738 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SryQ05738 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SryQ05738 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SryQ05738 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms