Protein–RNA interactions for Protein: Q05722

Col9a1, Collagen alpha-1(IX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a1Q05722 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Col9a1Q05722 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Col9a1Q05722 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Col9a1Q05722 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Col9a1Q05722 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Col9a1Q05722 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Col9a1Q05722 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Col9a1Q05722 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Col9a1Q05722 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Col9a1Q05722 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Col9a1Q05722 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Col9a1Q05722 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Col9a1Q05722 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Col9a1Q05722 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Col9a1Q05722 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Col9a1Q05722 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Col9a1Q05722 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Col9a1Q05722 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Col9a1Q05722 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Col9a1Q05722 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Col9a1Q05722 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Col9a1Q05722 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Col9a1Q05722 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Col9a1Q05722 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Col9a1Q05722 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Col9a1Q05722 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Col9a1Q05722 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Col9a1Q05722 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Col9a1Q05722 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Col9a1Q05722 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Col9a1Q05722 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Col9a1Q05722 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Col9a1Q05722 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Col9a1Q05722 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Col9a1Q05722 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Col9a1Q05722 Gm45609-206ENSMUST00000210176 1023 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Col9a1Q05722 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Col9a1Q05722 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Col9a1Q05722 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Col9a1Q05722 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Col9a1Q05722 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Col9a1Q05722 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Col9a1Q05722 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Col9a1Q05722 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Col9a1Q05722 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Col9a1Q05722 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Col9a1Q05722 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Col9a1Q05722 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Col9a1Q05722 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Col9a1Q05722 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Col9a1Q05722 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Col9a1Q05722 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Col9a1Q05722 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Col9a1Q05722 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Col9a1Q05722 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Col9a1Q05722 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Col9a1Q05722 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Col9a1Q05722 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Col9a1Q05722 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Col9a1Q05722 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Col9a1Q05722 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Col9a1Q05722 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Col9a1Q05722 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Col9a1Q05722 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Col9a1Q05722 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Col9a1Q05722 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Col9a1Q05722 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Col9a1Q05722 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Col9a1Q05722 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Col9a1Q05722 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Col9a1Q05722 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Col9a1Q05722 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Col9a1Q05722 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Col9a1Q05722 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Col9a1Q05722 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Col9a1Q05722 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Col9a1Q05722 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Col9a1Q05722 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Col9a1Q05722 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Col9a1Q05722 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Col9a1Q05722 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Col9a1Q05722 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Col9a1Q05722 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Col9a1Q05722 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Col9a1Q05722 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Col9a1Q05722 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Col9a1Q05722 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Col9a1Q05722 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Col9a1Q05722 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Col9a1Q05722 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Col9a1Q05722 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Col9a1Q05722 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Col9a1Q05722 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Col9a1Q05722 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Col9a1Q05722 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Col9a1Q05722 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Col9a1Q05722 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Col9a1Q05722 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Col9a1Q05722 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Col9a1Q05722 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.3 ms