Protein–RNA interactions for Protein: Q04750

Top1, DNA topoisomerase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top1Q04750 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Top1Q04750 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Top1Q04750 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Top1Q04750 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Top1Q04750 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Top1Q04750 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Top1Q04750 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Top1Q04750 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Top1Q04750 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Top1Q04750 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Top1Q04750 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Top1Q04750 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Top1Q04750 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Top1Q04750 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Top1Q04750 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Top1Q04750 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Top1Q04750 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Top1Q04750 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Top1Q04750 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Top1Q04750 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Top1Q04750 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Top1Q04750 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Top1Q04750 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Top1Q04750 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Top1Q04750 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Top1Q04750 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Top1Q04750 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Top1Q04750 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Top1Q04750 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Top1Q04750 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Top1Q04750 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Top1Q04750 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Top1Q04750 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Top1Q04750 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Top1Q04750 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Top1Q04750 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Top1Q04750 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Top1Q04750 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Top1Q04750 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Top1Q04750 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Top1Q04750 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Top1Q04750 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Top1Q04750 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Top1Q04750 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Top1Q04750 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Top1Q04750 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Top1Q04750 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Top1Q04750 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Top1Q04750 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Top1Q04750 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Top1Q04750 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Top1Q04750 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Top1Q04750 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Top1Q04750 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Top1Q04750 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Top1Q04750 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Top1Q04750 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Top1Q04750 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Top1Q04750 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Top1Q04750 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Top1Q04750 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Top1Q04750 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Top1Q04750 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Top1Q04750 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Top1Q04750 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Top1Q04750 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Top1Q04750 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Top1Q04750 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Top1Q04750 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Top1Q04750 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Top1Q04750 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Top1Q04750 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Top1Q04750 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Top1Q04750 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Top1Q04750 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Top1Q04750 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Top1Q04750 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Top1Q04750 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Top1Q04750 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Top1Q04750 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Top1Q04750 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Top1Q04750 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Top1Q04750 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Top1Q04750 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Top1Q04750 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Top1Q04750 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Top1Q04750 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Top1Q04750 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Top1Q04750 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Top1Q04750 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Top1Q04750 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Top1Q04750 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Top1Q04750 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Top1Q04750 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Top1Q04750 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Top1Q04750 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Top1Q04750 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Top1Q04750 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Top1Q04750 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Top1Q04750 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms