Protein–RNA interactions for Protein: Q04690

Nf1, Neurofibromin, mousemouse

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Length 2,841 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nf1Q04690 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nf1Q04690 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nf1Q04690 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nf1Q04690 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nf1Q04690 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nf1Q04690 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nf1Q04690 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nf1Q04690 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nf1Q04690 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nf1Q04690 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nf1Q04690 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nf1Q04690 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Nf1Q04690 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nf1Q04690 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nf1Q04690 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nf1Q04690 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nf1Q04690 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nf1Q04690 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nf1Q04690 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nf1Q04690 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nf1Q04690 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nf1Q04690 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nf1Q04690 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nf1Q04690 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nf1Q04690 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Nf1Q04690 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Nf1Q04690 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nf1Q04690 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nf1Q04690 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nf1Q04690 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Nf1Q04690 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nf1Q04690 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nf1Q04690 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nf1Q04690 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nf1Q04690 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nf1Q04690 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Nf1Q04690 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nf1Q04690 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nf1Q04690 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nf1Q04690 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nf1Q04690 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nf1Q04690 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nf1Q04690 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Nf1Q04690 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nf1Q04690 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nf1Q04690 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nf1Q04690 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nf1Q04690 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nf1Q04690 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nf1Q04690 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nf1Q04690 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nf1Q04690 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nf1Q04690 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nf1Q04690 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nf1Q04690 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nf1Q04690 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nf1Q04690 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nf1Q04690 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nf1Q04690 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nf1Q04690 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nf1Q04690 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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Nf1Q04690 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nf1Q04690 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nf1Q04690 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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Nf1Q04690 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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Nf1Q04690 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Nf1Q04690 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Nf1Q04690 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nf1Q04690 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Nf1Q04690 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nf1Q04690 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nf1Q04690 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nf1Q04690 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nf1Q04690 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nf1Q04690 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nf1Q04690 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nf1Q04690 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nf1Q04690 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nf1Q04690 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nf1Q04690 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nf1Q04690 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nf1Q04690 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nf1Q04690 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nf1Q04690 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nf1Q04690 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nf1Q04690 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nf1Q04690 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nf1Q04690 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nf1Q04690 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nf1Q04690 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nf1Q04690 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nf1Q04690 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
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