Protein–RNA interactions for Protein: Q03404

Tff2, Trefoil factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff2Q03404 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tff2Q03404 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tff2Q03404 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tff2Q03404 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tff2Q03404 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tff2Q03404 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tff2Q03404 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tff2Q03404 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tff2Q03404 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tff2Q03404 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tff2Q03404 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tff2Q03404 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Tff2Q03404 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tff2Q03404 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tff2Q03404 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Tff2Q03404 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tff2Q03404 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tff2Q03404 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tff2Q03404 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tff2Q03404 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tff2Q03404 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tff2Q03404 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tff2Q03404 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tff2Q03404 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tff2Q03404 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tff2Q03404 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tff2Q03404 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tff2Q03404 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tff2Q03404 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tff2Q03404 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tff2Q03404 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tff2Q03404 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tff2Q03404 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tff2Q03404 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tff2Q03404 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Tff2Q03404 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tff2Q03404 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Tff2Q03404 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Tff2Q03404 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tff2Q03404 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Tff2Q03404 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tff2Q03404 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tff2Q03404 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tff2Q03404 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tff2Q03404 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tff2Q03404 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Tff2Q03404 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tff2Q03404 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tff2Q03404 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tff2Q03404 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tff2Q03404 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tff2Q03404 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tff2Q03404 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tff2Q03404 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tff2Q03404 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tff2Q03404 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tff2Q03404 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tff2Q03404 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Tff2Q03404 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tff2Q03404 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tff2Q03404 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Tff2Q03404 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tff2Q03404 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tff2Q03404 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tff2Q03404 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tff2Q03404 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tff2Q03404 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tff2Q03404 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tff2Q03404 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tff2Q03404 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tff2Q03404 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tff2Q03404 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tff2Q03404 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tff2Q03404 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tff2Q03404 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Tff2Q03404 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tff2Q03404 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Tff2Q03404 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tff2Q03404 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tff2Q03404 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tff2Q03404 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tff2Q03404 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tff2Q03404 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tff2Q03404 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tff2Q03404 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tff2Q03404 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tff2Q03404 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tff2Q03404 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tff2Q03404 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tff2Q03404 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tff2Q03404 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Tff2Q03404 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tff2Q03404 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Tff2Q03404 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tff2Q03404 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tff2Q03404 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Tff2Q03404 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tff2Q03404 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tff2Q03404 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tff2Q03404 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms