Protein–RNA interactions for Protein: Q03146

Ddr1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddr1Q03146 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ddr1Q03146 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ddr1Q03146 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ddr1Q03146 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Ddr1Q03146 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ddr1Q03146 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ddr1Q03146 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ddr1Q03146 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ddr1Q03146 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ddr1Q03146 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Ddr1Q03146 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ddr1Q03146 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ddr1Q03146 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ddr1Q03146 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ddr1Q03146 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ddr1Q03146 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ddr1Q03146 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ddr1Q03146 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ddr1Q03146 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ddr1Q03146 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ddr1Q03146 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ddr1Q03146 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ddr1Q03146 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ddr1Q03146 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ddr1Q03146 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ddr1Q03146 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ddr1Q03146 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ddr1Q03146 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ddr1Q03146 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ddr1Q03146 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ddr1Q03146 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ddr1Q03146 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ddr1Q03146 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ddr1Q03146 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ddr1Q03146 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ddr1Q03146 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ddr1Q03146 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ddr1Q03146 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ddr1Q03146 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ddr1Q03146 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ddr1Q03146 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ddr1Q03146 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ddr1Q03146 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ddr1Q03146 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ddr1Q03146 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ddr1Q03146 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ddr1Q03146 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ddr1Q03146 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ddr1Q03146 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Ddr1Q03146 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ddr1Q03146 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ddr1Q03146 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ddr1Q03146 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ddr1Q03146 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ddr1Q03146 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Ddr1Q03146 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ddr1Q03146 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ddr1Q03146 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ddr1Q03146 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ddr1Q03146 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ddr1Q03146 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ddr1Q03146 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ddr1Q03146 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ddr1Q03146 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ddr1Q03146 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ddr1Q03146 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ddr1Q03146 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ddr1Q03146 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ddr1Q03146 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ddr1Q03146 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ddr1Q03146 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ddr1Q03146 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ddr1Q03146 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ddr1Q03146 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ddr1Q03146 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ddr1Q03146 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ddr1Q03146 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ddr1Q03146 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ddr1Q03146 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ddr1Q03146 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ddr1Q03146 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ddr1Q03146 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ddr1Q03146 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ddr1Q03146 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ddr1Q03146 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ddr1Q03146 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ddr1Q03146 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ddr1Q03146 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ddr1Q03146 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ddr1Q03146 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ddr1Q03146 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ddr1Q03146 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ddr1Q03146 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ddr1Q03146 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ddr1Q03146 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ddr1Q03146 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ddr1Q03146 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ddr1Q03146 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ddr1Q03146 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ddr1Q03146 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms