Protein–RNA interactions for Protein: Q02789

Cacna1s, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, mousemouse

Predictions only

Length 1,880 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1sQ02789 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cacna1sQ02789 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cacna1sQ02789 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cacna1sQ02789 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cacna1sQ02789 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cacna1sQ02789 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Cacna1sQ02789 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cacna1sQ02789 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cacna1sQ02789 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cacna1sQ02789 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Cacna1sQ02789 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cacna1sQ02789 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cacna1sQ02789 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cacna1sQ02789 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cacna1sQ02789 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cacna1sQ02789 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cacna1sQ02789 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cacna1sQ02789 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Cacna1sQ02789 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cacna1sQ02789 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cacna1sQ02789 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Cacna1sQ02789 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cacna1sQ02789 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cacna1sQ02789 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cacna1sQ02789 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cacna1sQ02789 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cacna1sQ02789 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cacna1sQ02789 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cacna1sQ02789 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cacna1sQ02789 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cacna1sQ02789 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cacna1sQ02789 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Cacna1sQ02789 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cacna1sQ02789 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Cacna1sQ02789 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Cacna1sQ02789 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cacna1sQ02789 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cacna1sQ02789 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cacna1sQ02789 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cacna1sQ02789 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cacna1sQ02789 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cacna1sQ02789 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Cacna1sQ02789 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cacna1sQ02789 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cacna1sQ02789 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cacna1sQ02789 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cacna1sQ02789 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cacna1sQ02789 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cacna1sQ02789 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cacna1sQ02789 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cacna1sQ02789 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cacna1sQ02789 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Cacna1sQ02789 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cacna1sQ02789 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cacna1sQ02789 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cacna1sQ02789 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cacna1sQ02789 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cacna1sQ02789 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Cacna1sQ02789 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Cacna1sQ02789 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Cacna1sQ02789 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cacna1sQ02789 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cacna1sQ02789 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cacna1sQ02789 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cacna1sQ02789 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cacna1sQ02789 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cacna1sQ02789 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cacna1sQ02789 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cacna1sQ02789 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cacna1sQ02789 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cacna1sQ02789 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cacna1sQ02789 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cacna1sQ02789 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cacna1sQ02789 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cacna1sQ02789 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cacna1sQ02789 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cacna1sQ02789 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cacna1sQ02789 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Cacna1sQ02789 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cacna1sQ02789 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cacna1sQ02789 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cacna1sQ02789 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cacna1sQ02789 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cacna1sQ02789 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cacna1sQ02789 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Cacna1sQ02789 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cacna1sQ02789 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cacna1sQ02789 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cacna1sQ02789 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cacna1sQ02789 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cacna1sQ02789 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cacna1sQ02789 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Cacna1sQ02789 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cacna1sQ02789 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cacna1sQ02789 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cacna1sQ02789 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Cacna1sQ02789 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Cacna1sQ02789 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cacna1sQ02789 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Cacna1sQ02789 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms