Protein–RNA interactions for Protein: Q02496

Muc1, Mucin-1, mousemouse

Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Muc1Q02496 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Muc1Q02496 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Muc1Q02496 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Muc1Q02496 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Muc1Q02496 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Muc1Q02496 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Muc1Q02496 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Muc1Q02496 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Muc1Q02496 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Muc1Q02496 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Muc1Q02496 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Muc1Q02496 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Muc1Q02496 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Muc1Q02496 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Muc1Q02496 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Muc1Q02496 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Muc1Q02496 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Muc1Q02496 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Muc1Q02496 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Muc1Q02496 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Muc1Q02496 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Muc1Q02496 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Muc1Q02496 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Muc1Q02496 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Muc1Q02496 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Muc1Q02496 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Muc1Q02496 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Muc1Q02496 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Muc1Q02496 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Muc1Q02496 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Muc1Q02496 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Muc1Q02496 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Muc1Q02496 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Muc1Q02496 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Muc1Q02496 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Muc1Q02496 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Muc1Q02496 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Muc1Q02496 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Muc1Q02496 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Muc1Q02496 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Muc1Q02496 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Muc1Q02496 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Muc1Q02496 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Muc1Q02496 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Muc1Q02496 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Muc1Q02496 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Muc1Q02496 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Muc1Q02496 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Muc1Q02496 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Muc1Q02496 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Muc1Q02496 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Muc1Q02496 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Muc1Q02496 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Muc1Q02496 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Muc1Q02496 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Muc1Q02496 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Muc1Q02496 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Muc1Q02496 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Muc1Q02496 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Muc1Q02496 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Muc1Q02496 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Muc1Q02496 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Muc1Q02496 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Muc1Q02496 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Muc1Q02496 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Muc1Q02496 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Muc1Q02496 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Muc1Q02496 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Muc1Q02496 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Muc1Q02496 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Muc1Q02496 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Muc1Q02496 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Muc1Q02496 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Muc1Q02496 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Muc1Q02496 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Muc1Q02496 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Muc1Q02496 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Muc1Q02496 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Muc1Q02496 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Muc1Q02496 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Muc1Q02496 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Muc1Q02496 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Muc1Q02496 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Muc1Q02496 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Muc1Q02496 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Muc1Q02496 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Muc1Q02496 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Muc1Q02496 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Muc1Q02496 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Muc1Q02496 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Muc1Q02496 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Muc1Q02496 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Muc1Q02496 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Muc1Q02496 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Muc1Q02496 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Muc1Q02496 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Muc1Q02496 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Muc1Q02496 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Muc1Q02496 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Muc1Q02496 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms