Protein–RNA interactions for Protein: Q02257

Jup, Junction plakoglobin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 745 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JupQ02257 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
JupQ02257 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
JupQ02257 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
JupQ02257 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
JupQ02257 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
JupQ02257 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
JupQ02257 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
JupQ02257 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
JupQ02257 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
JupQ02257 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
JupQ02257 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
JupQ02257 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
JupQ02257 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
JupQ02257 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
JupQ02257 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
JupQ02257 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
JupQ02257 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
JupQ02257 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
JupQ02257 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
JupQ02257 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
JupQ02257 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
JupQ02257 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
JupQ02257 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
JupQ02257 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
JupQ02257 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
JupQ02257 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
JupQ02257 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
JupQ02257 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
JupQ02257 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
JupQ02257 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
JupQ02257 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
JupQ02257 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
JupQ02257 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
JupQ02257 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
JupQ02257 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
JupQ02257 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
JupQ02257 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
JupQ02257 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
JupQ02257 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
JupQ02257 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
JupQ02257 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
JupQ02257 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
JupQ02257 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
JupQ02257 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
JupQ02257 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
JupQ02257 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
JupQ02257 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
JupQ02257 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
JupQ02257 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
JupQ02257 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
JupQ02257 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
JupQ02257 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
JupQ02257 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
JupQ02257 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
JupQ02257 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
JupQ02257 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
JupQ02257 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
JupQ02257 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
JupQ02257 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
JupQ02257 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
JupQ02257 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
JupQ02257 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
JupQ02257 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
JupQ02257 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
JupQ02257 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
JupQ02257 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
JupQ02257 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
JupQ02257 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
JupQ02257 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
JupQ02257 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
JupQ02257 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
JupQ02257 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
JupQ02257 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
JupQ02257 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
JupQ02257 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
JupQ02257 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
JupQ02257 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
JupQ02257 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
JupQ02257 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
JupQ02257 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
JupQ02257 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
JupQ02257 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
JupQ02257 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
JupQ02257 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
JupQ02257 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
JupQ02257 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
JupQ02257 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
JupQ02257 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
JupQ02257 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
JupQ02257 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
JupQ02257 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
JupQ02257 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
JupQ02257 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
JupQ02257 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
JupQ02257 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
JupQ02257 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
JupQ02257 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
JupQ02257 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
JupQ02257 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
JupQ02257 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms