Protein–RNA interactions for Protein: Q02242

Pdcd1, Programmed cell death protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd1Q02242 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pdcd1Q02242 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pdcd1Q02242 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pdcd1Q02242 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pdcd1Q02242 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pdcd1Q02242 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pdcd1Q02242 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pdcd1Q02242 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pdcd1Q02242 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pdcd1Q02242 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pdcd1Q02242 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pdcd1Q02242 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pdcd1Q02242 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pdcd1Q02242 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pdcd1Q02242 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pdcd1Q02242 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Pdcd1Q02242 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pdcd1Q02242 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pdcd1Q02242 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pdcd1Q02242 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pdcd1Q02242 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pdcd1Q02242 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pdcd1Q02242 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pdcd1Q02242 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pdcd1Q02242 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pdcd1Q02242 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pdcd1Q02242 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pdcd1Q02242 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pdcd1Q02242 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pdcd1Q02242 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pdcd1Q02242 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pdcd1Q02242 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pdcd1Q02242 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pdcd1Q02242 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pdcd1Q02242 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pdcd1Q02242 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pdcd1Q02242 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Pdcd1Q02242 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pdcd1Q02242 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pdcd1Q02242 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pdcd1Q02242 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pdcd1Q02242 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pdcd1Q02242 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pdcd1Q02242 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pdcd1Q02242 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pdcd1Q02242 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pdcd1Q02242 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pdcd1Q02242 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pdcd1Q02242 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pdcd1Q02242 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pdcd1Q02242 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pdcd1Q02242 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pdcd1Q02242 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pdcd1Q02242 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pdcd1Q02242 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pdcd1Q02242 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pdcd1Q02242 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pdcd1Q02242 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pdcd1Q02242 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pdcd1Q02242 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pdcd1Q02242 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pdcd1Q02242 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pdcd1Q02242 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pdcd1Q02242 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pdcd1Q02242 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pdcd1Q02242 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pdcd1Q02242 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Pdcd1Q02242 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pdcd1Q02242 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pdcd1Q02242 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pdcd1Q02242 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pdcd1Q02242 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pdcd1Q02242 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pdcd1Q02242 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pdcd1Q02242 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pdcd1Q02242 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Pdcd1Q02242 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pdcd1Q02242 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pdcd1Q02242 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pdcd1Q02242 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pdcd1Q02242 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pdcd1Q02242 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pdcd1Q02242 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pdcd1Q02242 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pdcd1Q02242 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pdcd1Q02242 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pdcd1Q02242 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pdcd1Q02242 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pdcd1Q02242 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pdcd1Q02242 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pdcd1Q02242 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pdcd1Q02242 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pdcd1Q02242 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pdcd1Q02242 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pdcd1Q02242 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pdcd1Q02242 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pdcd1Q02242 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pdcd1Q02242 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pdcd1Q02242 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pdcd1Q02242 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms