Protein–RNA interactions for Protein: Q02067

Ascl1, Achaete-scute homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl1Q02067 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ascl1Q02067 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ascl1Q02067 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ascl1Q02067 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ascl1Q02067 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ascl1Q02067 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ascl1Q02067 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ascl1Q02067 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ascl1Q02067 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ascl1Q02067 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ascl1Q02067 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ascl1Q02067 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ascl1Q02067 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ascl1Q02067 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ascl1Q02067 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ascl1Q02067 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ascl1Q02067 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ascl1Q02067 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ascl1Q02067 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ascl1Q02067 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ascl1Q02067 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ascl1Q02067 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ascl1Q02067 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ascl1Q02067 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ascl1Q02067 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ascl1Q02067 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ascl1Q02067 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ascl1Q02067 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ascl1Q02067 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ascl1Q02067 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ascl1Q02067 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ascl1Q02067 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ascl1Q02067 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ascl1Q02067 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ascl1Q02067 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ascl1Q02067 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ascl1Q02067 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ascl1Q02067 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ascl1Q02067 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ascl1Q02067 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ascl1Q02067 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ascl1Q02067 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ascl1Q02067 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ascl1Q02067 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ascl1Q02067 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ascl1Q02067 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ascl1Q02067 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ascl1Q02067 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ascl1Q02067 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ascl1Q02067 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ascl1Q02067 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ascl1Q02067 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ascl1Q02067 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ascl1Q02067 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ascl1Q02067 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ascl1Q02067 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ascl1Q02067 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ascl1Q02067 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ascl1Q02067 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ascl1Q02067 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ascl1Q02067 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ascl1Q02067 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ascl1Q02067 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ascl1Q02067 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ascl1Q02067 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ascl1Q02067 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ascl1Q02067 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ascl1Q02067 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ascl1Q02067 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ascl1Q02067 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ascl1Q02067 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ascl1Q02067 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ascl1Q02067 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ascl1Q02067 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ascl1Q02067 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ascl1Q02067 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ascl1Q02067 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ascl1Q02067 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ascl1Q02067 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ascl1Q02067 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ascl1Q02067 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ascl1Q02067 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ascl1Q02067 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ascl1Q02067 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ascl1Q02067 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ascl1Q02067 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ascl1Q02067 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ascl1Q02067 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ascl1Q02067 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ascl1Q02067 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ascl1Q02067 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ascl1Q02067 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ascl1Q02067 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ascl1Q02067 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ascl1Q02067 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ascl1Q02067 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ascl1Q02067 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ascl1Q02067 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ascl1Q02067 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ascl1Q02067 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms