Protein–RNA interactions for Protein: Q01727

Mc1r, Melanocyte-stimulating hormone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mc1rQ01727 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Mc1rQ01727 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mc1rQ01727 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mc1rQ01727 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mc1rQ01727 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mc1rQ01727 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mc1rQ01727 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mc1rQ01727 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mc1rQ01727 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mc1rQ01727 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Mc1rQ01727 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mc1rQ01727 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mc1rQ01727 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mc1rQ01727 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mc1rQ01727 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mc1rQ01727 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mc1rQ01727 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mc1rQ01727 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mc1rQ01727 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mc1rQ01727 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mc1rQ01727 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mc1rQ01727 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mc1rQ01727 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mc1rQ01727 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mc1rQ01727 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Mc1rQ01727 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mc1rQ01727 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mc1rQ01727 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mc1rQ01727 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mc1rQ01727 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mc1rQ01727 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mc1rQ01727 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mc1rQ01727 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mc1rQ01727 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mc1rQ01727 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mc1rQ01727 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mc1rQ01727 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Mc1rQ01727 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mc1rQ01727 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mc1rQ01727 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mc1rQ01727 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mc1rQ01727 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mc1rQ01727 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mc1rQ01727 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mc1rQ01727 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Mc1rQ01727 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Mc1rQ01727 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Mc1rQ01727 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mc1rQ01727 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mc1rQ01727 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mc1rQ01727 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mc1rQ01727 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mc1rQ01727 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mc1rQ01727 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mc1rQ01727 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mc1rQ01727 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mc1rQ01727 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mc1rQ01727 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mc1rQ01727 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Mc1rQ01727 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Mc1rQ01727 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Mc1rQ01727 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Mc1rQ01727 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Mc1rQ01727 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Mc1rQ01727 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Mc1rQ01727 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Mc1rQ01727 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Mc1rQ01727 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Mc1rQ01727 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Mc1rQ01727 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Mc1rQ01727 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Mc1rQ01727 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Mc1rQ01727 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Mc1rQ01727 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Mc1rQ01727 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Mc1rQ01727 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Mc1rQ01727 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Mc1rQ01727 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Mc1rQ01727 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Mc1rQ01727 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Mc1rQ01727 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Mc1rQ01727 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mc1rQ01727 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mc1rQ01727 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mc1rQ01727 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mc1rQ01727 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mc1rQ01727 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mc1rQ01727 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mc1rQ01727 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mc1rQ01727 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mc1rQ01727 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mc1rQ01727 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mc1rQ01727 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mc1rQ01727 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mc1rQ01727 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Mc1rQ01727 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mc1rQ01727 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mc1rQ01727 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mc1rQ01727 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mc1rQ01727 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms