Protein–RNA interactions for Protein: Q01514

Gbp1, Guanylate-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp1Q01514 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gbp1Q01514 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gbp1Q01514 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gbp1Q01514 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gbp1Q01514 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gbp1Q01514 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gbp1Q01514 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gbp1Q01514 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gbp1Q01514 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gbp1Q01514 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gbp1Q01514 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gbp1Q01514 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gbp1Q01514 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gbp1Q01514 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gbp1Q01514 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gbp1Q01514 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gbp1Q01514 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gbp1Q01514 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gbp1Q01514 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gbp1Q01514 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gbp1Q01514 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gbp1Q01514 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gbp1Q01514 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gbp1Q01514 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gbp1Q01514 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Gbp1Q01514 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Gbp1Q01514 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gbp1Q01514 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gbp1Q01514 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gbp1Q01514 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gbp1Q01514 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gbp1Q01514 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gbp1Q01514 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gbp1Q01514 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gbp1Q01514 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gbp1Q01514 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gbp1Q01514 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gbp1Q01514 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Gbp1Q01514 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Gbp1Q01514 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Gbp1Q01514 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Gbp1Q01514 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gbp1Q01514 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Gbp1Q01514 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gbp1Q01514 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gbp1Q01514 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gbp1Q01514 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gbp1Q01514 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gbp1Q01514 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gbp1Q01514 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gbp1Q01514 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gbp1Q01514 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gbp1Q01514 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gbp1Q01514 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gbp1Q01514 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gbp1Q01514 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Gbp1Q01514 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gbp1Q01514 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gbp1Q01514 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gbp1Q01514 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gbp1Q01514 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gbp1Q01514 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gbp1Q01514 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gbp1Q01514 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gbp1Q01514 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gbp1Q01514 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gbp1Q01514 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gbp1Q01514 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gbp1Q01514 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gbp1Q01514 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gbp1Q01514 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gbp1Q01514 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gbp1Q01514 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gbp1Q01514 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gbp1Q01514 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gbp1Q01514 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gbp1Q01514 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gbp1Q01514 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gbp1Q01514 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gbp1Q01514 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gbp1Q01514 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gbp1Q01514 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gbp1Q01514 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gbp1Q01514 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gbp1Q01514 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gbp1Q01514 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gbp1Q01514 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gbp1Q01514 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Gbp1Q01514 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gbp1Q01514 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gbp1Q01514 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gbp1Q01514 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gbp1Q01514 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Gbp1Q01514 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gbp1Q01514 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gbp1Q01514 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gbp1Q01514 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gbp1Q01514 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gbp1Q01514 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Gbp1Q01514 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms