Protein–RNA interactions for Protein: Q01405

Sec23a, Protein transport protein Sec23A, mousemouse

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23aQ01405 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sec23aQ01405 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sec23aQ01405 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sec23aQ01405 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sec23aQ01405 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Sec23aQ01405 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sec23aQ01405 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sec23aQ01405 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sec23aQ01405 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sec23aQ01405 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sec23aQ01405 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sec23aQ01405 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sec23aQ01405 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Sec23aQ01405 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sec23aQ01405 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sec23aQ01405 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sec23aQ01405 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sec23aQ01405 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sec23aQ01405 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sec23aQ01405 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sec23aQ01405 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Sec23aQ01405 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sec23aQ01405 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sec23aQ01405 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sec23aQ01405 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sec23aQ01405 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sec23aQ01405 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sec23aQ01405 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sec23aQ01405 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sec23aQ01405 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sec23aQ01405 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sec23aQ01405 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Sec23aQ01405 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sec23aQ01405 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sec23aQ01405 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sec23aQ01405 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sec23aQ01405 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sec23aQ01405 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sec23aQ01405 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sec23aQ01405 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sec23aQ01405 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sec23aQ01405 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sec23aQ01405 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Sec23aQ01405 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sec23aQ01405 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Sec23aQ01405 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sec23aQ01405 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sec23aQ01405 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sec23aQ01405 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sec23aQ01405 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sec23aQ01405 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sec23aQ01405 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sec23aQ01405 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sec23aQ01405 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sec23aQ01405 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sec23aQ01405 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sec23aQ01405 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sec23aQ01405 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sec23aQ01405 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sec23aQ01405 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sec23aQ01405 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sec23aQ01405 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sec23aQ01405 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sec23aQ01405 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sec23aQ01405 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sec23aQ01405 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sec23aQ01405 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sec23aQ01405 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sec23aQ01405 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sec23aQ01405 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sec23aQ01405 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sec23aQ01405 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Sec23aQ01405 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sec23aQ01405 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sec23aQ01405 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sec23aQ01405 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sec23aQ01405 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sec23aQ01405 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sec23aQ01405 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Sec23aQ01405 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sec23aQ01405 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sec23aQ01405 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sec23aQ01405 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sec23aQ01405 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Sec23aQ01405 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sec23aQ01405 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sec23aQ01405 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sec23aQ01405 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sec23aQ01405 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sec23aQ01405 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sec23aQ01405 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sec23aQ01405 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sec23aQ01405 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Sec23aQ01405 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sec23aQ01405 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sec23aQ01405 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sec23aQ01405 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sec23aQ01405 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sec23aQ01405 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sec23aQ01405 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms